莒南县文化市场管理执法局的科室职责如下：
办公室：主要负责局机关的日常协调工作，包括文电处理、会议组织、秘书事务、信息综合、宣传、督查、机要、档案、安全保密、文印、印章管理、对外联络接待、固定资产管理和后勤服务。此外，还负责办公用品购置、保管、发放，以及局网站的维护和信息上传，全局考勤管理和请销假管理，人事及离退休人员管理工作，以及部分招商引资和纪检监察任务。
监督管理科：主要职责在于拟定和实施全县文化市场发展规划，指导综合执法工作，监管文化领域经营活动，处理经营许可、审核申报、年检监督等事宜。此外，还负责现场勘察、公示，查处违法违规活动，监管演艺、出版、文艺类产品网上传播、文化娱乐场所、营业性演出等，并负责互联网上网服务营业场所和网络游戏服务的监管。
法规科：负责合法性审核、执法队伍督察、行政处罚、案件上报、档案管理等工作，对外宣传法规、参与行政诉讼和复议，培训执法人员和经营业主，监督协会工作，查处违法违规出版活动等。
机关党支部：作为党的组织，负责支部会议、党的路线传达、工作计划制定和执行、思想政治工作、党员管理、精神文明建设和计划生育等工作。
局“扫黄打非”办公室：负责“扫黄打非”政策的制定和执行，组织查处非法出版物，参与文化市场和“扫黄打非”联合行动，监管卫星接收设施，以及文物执法和县网吧行业协会相关工作。
财务科：制定财务制度，编制预算，管理资产，负责经费审核、支付和会计档案保管，执行收支两条线，以及内部审计工作。
网络监控与举报中心：负责网络监控系统维护、技术管理，全天候监控文化市场，处理违法违规现象，接听举报并提供监控视频资料，确保监控设备正常运行，以及接待讲解演示等职责。