在实时荧光定量PCR (qPCR) 中,Cq 值代表着 PCR 反应的阈值。Cq 值越低,说明模板开始翻倍的时间越早,即样本中的目标基因含量越高。因此,Cq 值可以用来估计目标基因表达量的相对水平。
在 qPCR 中,表达量通常使用 2^-ΔΔCt 方法进行分析,其中ΔΔCt 是指两个基因,如目标基因和参考基因,在不同样本之间的 Cq 值差异。具体步骤如下:
1、根据实验需要,选择一个稳定的参考基因并确定其 Cq 值。
2、计算目标基因和参考基因在每个样本中的ΔCt 值,即对于每个样本,用参考基因的 Cq 值减去目标基因的 Cq 值,得到ΔCt。
3、计算每个样本的 ΔΔCt 值,即用待比较样本的 ΔCt 值减去一个对比样本的 ΔCt 值,得到 ΔΔCt。
4、计算每个样本的目标基因表达量的相对水平,即将 ΔΔCt 值代入公式 2^-ΔΔCt 中。这将得出一个相对表达量值,说明待比较样本中目标基因相对于对比样本的变化水平。
Cq 值和基因表达量之间呈反比例关系。Cq 值越低,目标基因含量越高,表达量也就越高。通过ΔΔCt 方法分析 qPCR 数据时,Cq 值的相对差异和变化越小,则目标基因的表达水平差异和变化也就越小。因此,Cq 值和表达量分析是相辅相成的。
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