人类历史上，爆发了不少的瘟疫和疾病，但最为神秘的恐怕就是中世纪欧洲的黑死病，从1348年到1352年，它将欧洲变成了“坟场”，2500万人死于这场疾病，但是黑死病来无影去无踪，给历史上留下了一个巨大的谜团。
黑死病最初是1338年，在中亚的一个小城被发现，向南传入了印度，1347年，黑死病已经进入了君士坦丁堡——拜占庭最大的贸易城市，黑死病随着人群不断向各国扩散，很快席卷了欧洲大地。
黑死病的最初病状是腹股沟或腋下的淋巴肿块，然后，胳膊和大腿以及身体其他部分出现青黑色的疱疹，在感染黑死病之后，几乎所有的患者都会在3天内死亡，极少有人能够幸免。
除了欧洲大陆，黑死病（鼠疫）还通过搭载帆船的老鼠身上的跳蚤跨过英吉利海峡，蔓延到英国全境，感染黑死病的人尝试各种疗法，甚至灼烧淋巴肿块，但都无济于事，而德国的梅因兹，将犹太人当做瘟疫的传播者，近3万人犹太人被杀。
但只有极少数人，清楚认识到了黑死病的源头可能是来自动物，猫成为的第一批“受害者”，猫的鸣叫和闪烁凶光的眼睛，被认为是魔鬼撒旦的化身，在教会的鼓动下，人们开始捕猎猫，然而没有猫捕猎老鼠，黑死病更加肆无忌惮。
中世纪黑死病成为了欧洲的梦魇，后来法王路易十四甚至认为黑死病是通过空气传播的，他就不愿意洗澡，只用香水来掩盖体味，香水成了法国的热销品，这也是为什么法国香水享誉全球。
然而这场横行300多年的的黑死病，却在1666年突然消失了，这年9月10日，伦敦布丁巷内一家面包店发生了火灾，当时伦敦极为干燥，加上都是木质建筑，大火很快蔓延了开来，这场火持续烧了三天三夜，五分之四的地区被毁，但奇特的是，黑死病彻底消失了。
但关于黑死病的研究，一直都没有停止过，1894年，法国细菌学家亚历山大·耶尔森发生了鼠疫的病原体，命名为耶尔森鼠疫杆菌，并提出主要的传播途径是鼠和跳蚤，1996年，两位英国科学家斯科特和邓肯，研究了鼠疫变异，其中一个就是CCR5.32变异。
这种传染病可能是一种病毒性出血热导致，跟埃博拉出血热类似，这种出血热在公元1500年埃及地区就已经出现，这种病潜伏期长达37至38天，跟14世纪意大利提出的40天有效隔离期吻合。
除此之外，学术界还提出的一种假设，黑死病是寄生在欧洲的黑老鼠身上，但1927年，亚洲褐家鼠因为印度岁的一场地震开始迁移，它们跋山涉水进入了欧洲，褐家鼠比起黑老鼠更加强壮，它们夺走了黑老鼠的生存环境。
不过寄生在褐家鼠身上的角叶蚤不会轻易脱离“母体”，一旦脱离，在其余的寄生体上，只能存活几个月，这种跳蚤难以感染人类，随着黑老鼠灭绝，黑死病也逐渐消失了，此后人类认识到控制源头的重要性，在第三次黑死病爆发时，并没有造成太大的破坏。