2001年羽翼丰满的佩佩开始了在欧洲足坛的闯荡，他加盟的首个欧洲俱乐部是葡萄牙的马尔蒂默B队。仅仅参加了10场比赛，佩佩就被马尔蒂默俱乐部升级到了一队。2002-03赛季，佩佩与荷兰球员范德加德组成的马尔蒂默中卫线赢得了葡萄牙球迷的一致好评。
佩佩在葡超联赛的演出为他赢得了多家俱乐部的注意，其中就包括土耳其超级劲旅的加拉塔萨雷。不过在俄罗斯名帅贝绍维茨的力劝下，佩佩又在马尔蒂默待了一个赛季。在那一年中，佩佩在贝绍维茨手中尝试了多个角色——从中后卫到后腰，甚至是前锋。 2004年波尔图赢得了欧冠联赛的锦标，不过当年夏天从主教练穆里尼奥到核心球员德科、费雷拉和卡瓦略均一股脑地前往欧洲淘金，这使得新科的欧洲冠军不得不在转会市场挖掘新矿。身体强壮而又不失灵活的佩佩正是达科斯塔主席引援的头号人选，最终“巨龙”以100万欧元的身价拿下了巴西中卫。
佩佩和另外三名队友一起以100万欧元的身价加盟波尔图。当然马尔蒂默队并不是没有看出佩佩的潜力，在佩佩的合同中规定马尔蒂默队将获得佩佩下次转会时全部转会费中的20%。
在波尔图的第一个赛季难称成功，初来乍到的佩佩并没有赢得荷兰教练阿德里安塞的全部信任，在巨龙球场他不得不为佩德罗.埃曼纽尔、乔治.科斯塔和里卡多.科斯塔等人担当替补，整个赛季巴西人仅仅上场14次。不过由于波尔图在2005年战绩出现了严重的滑坡，阿德里安塞承受了巨大的压力，荷兰人也不得不将球队的阵型调整为攻击力更强的3-4-3，而佩佩则是三后卫的重要人选，第二个赛季佩佩赢得了24次首发的机会。
2006年，佩佩拿到了欧盟护照成为一名拥有葡萄牙和巴西双重国籍的欧洲公民。在06-07赛季，虽然逐渐信赖自己的阿德里安塞在赛季前黯然下课，但这并没有影响到佩佩的光明前程，在前博阿维斯塔老帅费雷拉手中他依然是不可或缺的球员。佩佩的同胞兼好友德科在效力国家队无望后转投葡萄牙队，并一举成为世界级球星。而在葡超联赛表现抢眼的佩佩则成为了斯科拉里为葡萄牙队积极争取的第二个目标，不过佩佩在世界杯的诱惑下依然拒绝了斯科拉里的邀请。他相信自己在未来有能力在巴西国家队赢得立足之地！
佩佩在这里效力的三个赛季，共为波尔图队在各项赛事中出场88次打进8球，帮助球队夺得两次联赛冠军、一次葡萄牙杯赛冠军、一次葡萄牙超级杯冠军和一次丰田杯冠军。 2007年7月10日，波尔图主席达科斯塔宣布皇马击败了诸多竞争对手以3000万欧元的天价得到了佩佩。这是皇马新任教练舒斯特尔签下的第一人，消息一经传出全世界足坛为之震惊！大家都在怀疑皇马为一名在葡萄牙联赛踢球的巴西后卫居然付出如此代价！
2007年夏天，佩佩以创俱乐部纪录的3000万欧元的身价转会加盟西甲豪门皇家马德里队，签约五年。
加盟皇马的第一个赛季佩佩就帮助皇马夺得当赛季西甲联赛冠军，在这个赛季佩佩的表现获得西班牙媒体好评，GOAL网站评价他的表现为9颗星(满分10颗)。
然而佩佩在皇马既是天使也是魔鬼：2007年11月8日他在训练中殴打队友哈维尔· 巴尔博亚，事后并未受到任何处罚；2009年4月21日，在皇马主场与赫塔菲队的比赛中，佩佩先是在禁区内撞到了对方球员哈维尔· 卡斯奎罗，然后又在已经倒地的对手身上连踢两脚，佩佩当场被红牌罚下，随后又遭到西班牙足协追加禁赛10场的处罚。
09/10赛季，佩佩在与塞维利亚队的比赛中打进了自己在西甲联赛的首粒进球；不过在12月13日与瓦伦西亚队的比赛中，佩佩十字韧带断裂据报道将休战6个月，世界杯前才有望复出。
11/12赛季，佩佩跟随穆里尼奥夺得了西甲联赛冠军。
2015年8月21日，西甲豪门皇马官方宣布，就续约与佩佩达成协议，双方合同延长一年，合约期至2017年夏天；佩佩完成这份合同后，将年满34岁，基本意味着将在伯纳乌终老。在佩佩与皇马续约后，银河战舰在俱乐部官网刊登一则通告：“皇马与佩佩就续约达成了一致，佩佩的新合同将到2017年6月30号到期。” 2006年，佩佩拿到了欧盟护照成为一名拥有葡萄牙和巴西双重国籍的欧洲公民。同胞兼好友德科在效力国家队无望后转投葡萄牙队，并一举成为世界级球星，而此时的佩佩依然认为凭自己的实力可以入选祖国巴西的国家队。然而落选了2006年巴西队世界杯阵容之后佩佩大失所望，2007年8月他正式成为葡萄牙国家队一员，并与8月31日代表葡萄牙队打了第一场正式比赛。
2008年瑞士奥地利欧洲杯上，在葡萄牙与土耳其的的小组赛中，佩佩在下半时60分钟，与队友进行二过一传接配合打进一球，完成了他在国家队的第一个进球，同时这个进球也是葡萄牙本届杯赛的第一个进球。
2012年跟随穆里尼奥夺得了西甲联赛冠军，同年代表葡萄牙对征战波兰/乌克兰欧洲杯，并帮助球队打进4强。
2014年巴西世界杯，G组的第一场比赛中，葡萄牙队中卫佩佩在上半场因为侵犯托马斯·穆勒而被红牌罚下。佩佩没有控制住自己的情绪，他低头撞了穆勒的脑袋。这样的动作让他付出了代价，来自塞尔维亚的主裁判马季奇直接向他出示了红牌。
根据世界杯的规则，吃到红牌的球员会自动停赛一场。不过由于佩佩的非体育行为影响恶劣，他可能会被追加处罚。据路透社的消息，佩佩可能面临停赛3场的处罚，这对葡萄牙而言无疑是一个重大打击。本赛季效力皇马的佩佩打出了神级表现，他也被视为皇马赢得国王杯跟欧冠的绝对功臣之一，葡萄牙缺少他无疑防守会下降一层，前景堪忧。
北京时间3月19日报道，“瓦拉内让拉莫斯和佩佩的搭档分裂”，《马卡报》今天做出了这样的报道。在一月份佩佩受伤拉莫斯遭到五场停赛，瓦拉内趁机连续首发并踢出了世界级的表现。如今，瓦拉内成了皇马主力中卫人选，被他夺走位置的是佩佩。据《机密报》报道称，佩佩对此感到非常愤怒。
