避孕套主要是采取橡胶制成，虽然对于人体的危害比较小，但首先有些对于橡胶过敏的朋友则是需要注意的，同时为了达到润滑效果避孕套外面通常会添加很多油脂，一些矿物油本身就不易分解，又处于阴道内部不易清洗，这些润滑剂中含有的某种成分会破坏阴道里的免疫系统。
精子能抗菌消炎，有正常和谐性生活的妇女，其生殖道内经常有丈夫的精液“光临”，正是精液的抗菌消炎作用使这些妇女减少了生殖道感染的罹患率。假设每周使用两次的话，矿物油的残留都相当可观，经常带避孕套，这些油脂长期存在于阴道内，破坏了的酸性环境，使得病菌更易滋生。
有些女性体内存在抗精子抗体，性交后精子进入宫颈，与宫黏粘液中的抗精子抗体结合。结合后精子凝集或者制动，无法继续游走进入子宫内部，因此不孕。
研究发现如果使用避孕套三个月至半年，让女性暂时与精液断绝接触，使其体内的抗精子抗体滴度下降，这样停用避孕套后就可能在短期内怀孕。
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