如果货物从保税区最终进入了国内，进口关税和增值税一样需要交纳的，区别只是在于这个税由谁来交；如果是国内客户向保税区海关申报进口，那就是客户交；如果是贸易公司向保税区海关申报进口在国内转卖给客户，那就是贸易公司向海关交；
当然如果这个货物最终的客户是在国外的，没有进入国内，那么从保税区出口至国外就无需交纳进口关税和增值税。
“经海关批准暂时进口或暂时出口的货物，以及特准进口的保税货物，在货物收、发货人向海关缴纳相当于税款的保证金或者提供担保后，将予暂时免纳关税。”
保税货物经海关核准转为进入国内市场销售时，由货主或其代理人向海关递交进口货物许可证，进口货物报关单和海关需要的其它单证，并缴纳关税和增值税后，由海关签印放行，将原进口货物报关单注销。
扩展资料：
由于增值税实行凭增值税专用发票抵扣税款的制度，因此对纳税人的会计核算水平要求较高，要求能够准确核算销项税额、进项税额和应纳税额。
但实际情况是有众多的纳税人达不到这一要求，因此《中华人民共和国增值税暂行条例》将纳税人按其经营规模大小以及会计核算是否健全划分为一般纳税人和小规模纳税人。
一般纳税人
（1）生产货物或者提供应税劳务的纳税人，以及以生产货物或者提供应税劳务为主（即纳税人的货物生产或者提供应税劳务的年销售额占应税销售额的比重在50%以上）并兼营货物批发或者零售的纳税人，年应税销售额超过50万的；
（2）从事货物批发或者零售经营，年应税销售额超过80万元的。
小规模纳税人
（1）从事货物生产或者提供应税劳务的纳税人，以及从事货物生产或者提供应税劳务为主（即纳税人的货物生产或者提供劳务的年销售额占年应税销售额的比重在50%以上），并兼营货物批发或者零售的纳税人，年应征增值税销售额（简称应税销售额）在50万元以下（含本数）的。
（2）除上述规定以外的纳税人，年应税销售额在80万元以下（含本数）。
参考资料来源：百度百科-增值税
进入国内销售，就演变成了“出口转内销”（之前你们申报的是这批货物要用于出口的，所以才可以进入保税区啊），出口转内销，使得全过程之处的进口就无权保税了，而是一般贸易了。自然要补税，肯定的。
参考以下官方规定：
海关法》第43条规定：“经海关批准暂时进口或暂时出口的货物，以及特准进口的保税货物，在货物收、发货人向海关缴纳相当于税款的保证金或者提供担保后，将予暂时免纳关税。”
保税货物经海关核准转为进入国内市场销售时，由货主或其代理人向海关递交进口货物许可证，进口货物报关单和海关需要的其它单证，并缴纳关税和增值税后，由海关签印放行，将原进口货物报关单注销。
当然如果这个货物最终的客户是在国外的，没有进入国内，那么从保税区出口至国外就无需交纳进口关税和增值税。
如果是“手册进口”一样的性质，内销后是为了生产再出口，那也是不需要的。
还有些细节问题，咨询海关或者税务较好。