科大医院作为综合性医疗中心，拥有多个专业部门以满足患者的全方位医疗需求。其中包括西医部，涵盖了全科、普外科、皮肤科、心脏科、妇产科、儿科、骨科、眼科、精神科、耳鼻喉科、心理科以及家庭医学专科等，满足了各类疾病的诊疗服务。此外，肠胃肝胆科和脊骨神经科也提供专业治疗，营养科和康复科则关注病后的恢复和健康维护。在预防方面，医院还提供疫苗注射服务，如流感、甲乙型肝炎、破伤风和水痘疫苗。
中医门诊则侧重于中医特色服务，包括内科、妇科、儿科、骨伤科、肛肠科等传统科室，以及针灸科、推拿科和皮肤科，满足不同年龄段和身体状况的患者对中医诊疗的需求。美容科也作为其中一部分，提供美容服务。
除了上述专业部门，科大医院还设有睡眠诊疗中心、国际健康管理中心、国际医务中心，以及中医药学院专家临床中心和临床化验诊断中心、医学影像诊断中心，这些都为患者提供了高质量的诊断和治疗保障。同时，医院还特别关注皮肤及激光治疗和肿瘤综合治疗，致力于提供全方位、个性化的医疗服务。
科大医院（英语：THE UNIVERSITY HOSPITAL）位于澳门氹仔伟龙马路澳门科技大学H座大楼，于2003年10月8日获澳门卫生局批准成立，隶属于澳门科技大学基金会，是一间非牟利机构，是澳门第一所具有中西医互补为特色的综合性医院。