Sml组织的美色偷取了猪蹄组织的中心元件，然后带着中心元件逃上了蜡笔小新的船，但猪蹄组织的人早就知道了美色的去向，跟踪美色找到了蜡笔小新的这艘船，然后开着飞船将这艘船给勾了起来，就这样蜡笔小新几人卷入了正邪之战中。刚开始时，蜡笔小新的父母知道了蜡笔小新的消息之后，也是感觉非常难受的，因为他们不知道怎么才能将自己的儿子给带回来，儿子的去向他们也不知道，后来sml组织的另外一个成员联络了他们，他们这才知道自己的儿子被带去了香港，于是他们便百般哀求这位成员带自己一起去找儿子，因为他们不放心别人来做这件事情，有了救儿子的希望，哪怕这希望再小他们也是不会放弃的。
最后在sml组织成员和蜡笔小新父母的努力之下，几人也成功被救了回来，而这部剧也将以大团圆结局结尾。蜡笔小新这部动漫的画风一直是比较奇怪的，不同于其他动漫的瓜子脸和大眼睛，这部动漫将重心放到了人物性格的刻画以及剧情的发展上面，并没有过多地去刻画人物的美貌和帅气。而这也是蜡笔小新受到了很多人喜爱的原因，可以说，蜡笔小新这部动漫是很多人的童年。而在蜡笔小新的动漫之后，也出了很多剧场版的电影，每一部电影的主题都是不一样的，有美食大逃亡，有宇宙人，有奇异乐园等主题，每一部电影都非常精彩，让人流连忘返。
蜡笔小新这部动漫是非常成功的，而它的成功程度可以与柯南这部动漫相媲美，在国内都受到了非常多人的喜爱，而在喜爱蜡笔小新的人群当中，不止有很多小孩，还有很多成年人。因为从观看蜡笔小新的过程当中，成年人也可以学到一些人生道理，也会为电影中的剧情而感动。
在剧场版中，蜡笔小新几人总是会卷入一些正与邪的对决当中，而每次都会在其中起到关键性的作用，毕竟几人是主角，戏份更多的肯定是主角。有的剧场版讲述的是亲情，有的剧场版讲述的是友情，而有的剧场版则讲述的是爱情。在蜡笔小新的动漫当中，我们可以看到人生的百态，也可以看到很多奇妙的幻想，而这些幻想也同样是我们自己的童年。