明朝是朱姓的鼎盛时期，朱姓迅速地向全国发展，居住在闽、粤等沿海地区的朱氏，陆续有人移居台湾。清朝时，进而又有人远徙东南亚及欧美一些国家和地区。
据资料表明，宁藩的一部分宗室后裔，明亡后仍留居江西，直到今天，仍是江西朱氏中的重要一支。这支家族在清末民国时还续修了《江西八支朱氏宗谱》，至今仍保存在江西省博物馆。另湖北沔阳一带，今天也有明朝宗室后裔存在。
每当朝代鼎革时，新建的王朝总要铲除前朝皇族。但没有哪一个政权像满清王朝一样，因为自己是异族入侵，做贼心虚，对明朝宗室怕得要命，所以清初对明宗实行血腥的屠杀政策。这给凤阳朱氏带来了比明末农民起义更残酷、更可怕的灾难。直到康熙时期(公元1662--1722年)，情况才稍有变化。
康熙七年(公元1668年)，清圣祖爱新觉罗·玄烨才下了这样一道圣旨：“诏故明宗室子孙众多，有窜伏山林者，令悉归田里;有改姓埋名者，姓氏皆复旧。”康熙二十三年(公元1684年)、三十八年(公元1699年)，康熙帝南巡时，又两次到南京拜祭明开国皇帝朱元璋的葬的孝陵，并下令求访明朝后裔，使奉守朱氏世祀。但因无法访察，没有结果。再到雍正二年(公元1724年)，清世宗胤禛正式访查出明宗室后裔朱之琏，封为一等侯，入正白旗令世袭，以奉明孝陵的春秋祀事(这样，明皇族后裔又有一支加入满族)。至此，明宗室后裔才结束逃亡生活，恢复了普通平民的身份。
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