广州地铁二号线的站点分布多样，各具特色。首站是位于白云区广园西路与三元里大道交界处的三元里站，南北走向，作为二号线北端的折返站，它是一个地下二层的车站，全长280.5米，设有四个通道和六个出入口。
广州火车站是二号线和五号线的换乘站，坐落在越秀区环市西路东侧，与流花路、站前路等临近。这里是中国铁路的重要枢纽，广深、京广、广三铁路交汇，周边聚集了服装、皮具、鞋业等大型批发市场，吸引着中东外商采购货物。
越秀公园站位于解放北路与流花路交汇，南北走向，附近有锦汉展览中心、中国大酒店等，是历史、商贸与旅游的融合区域，靠近越秀公园和西汉南越王墓博物馆。
纪念堂站位于东风中路与连新路交汇处，以纪念中山先生而得名，是广州经济、政治的交汇点，临近广东省人民政府和市人大。
位于市中心中山五路的公园前站，是地铁一、二号线的换乘站，邻近北京路、西湖路商业步行街，是繁华的购物天堂，车站全长接近500米，采用一岛二侧设计。
海珠广场站位于海珠广场西侧，江中路、一德路、侨光西路交汇，开放四个出入口，方便前往一德路、海珠广场等商业区，还有酒吧一条街。
市二宫站位于江南大道北与同福东路交汇处，南北走向，是一个地下二层的岛式站台，周边有婚纱街、蓝色快线地下商业街，形成了休闲购物与娱乐的文化氛围。
而江南西站则位于江南大道与江南西路交汇处以北，车站为地下三层结构，岛式设计，邻近繁华的商业街，为乘客提供了便捷的交通服务。
二号线首通段（三元里─晓港）于2002年12月29日开始试运营。2003年6月28日地铁二号线三元里─琶洲段开始正式营运。二号线使用了很多国内乃至国际上都处于领先地位的技术。广州地铁二号线是世界上全线都在建成时就安装了屏蔽门的地铁线路之一。屏蔽门可确保乘客候车时的安全，还能节省能源消耗。二号线已有17车站投入使用，分别为：三元里、广州火车站、越秀公园、纪念堂、公园前，海珠广场，市二宫，江南西，晓港，中大，鹭江，客村，赤岗，磨碟沙，新港东，琶洲，万胜围，全部为地下车站。