云南有云南大学、昆明理工大学、云南师范大学、云南农业大学、昆明医科大学5所一本大学。
1、云南大学
云南大学始建于1922年，时为私立东陆大学。1930年，改为省立东陆大学。1934年更名为省立云南大学。1938年改为国立云南大学。1946年，《不列颠百科全书》将云南大学列为中国15所在世界最具影响的大学之一。
1950年定名为云南大学。1958年，云南大学由中央高教部划归云南省管理。1978年，云南大学被国务院确定为88所全国重点大学之一。1996年首批列入国家“211工程”重点建设大学。1999年，云南政法高等专科学校并入云南大学。
2、昆明理工大学
学校由原昆明理工大学与原云南工业大学于1999年合并组建。原昆明理工大学创建于1954年，时名昆明工学院，1995年更名为昆明理工大学。
原云南工业大学创建于1974年，时名云南工学院，1994年更名为云南工业大学，历史起点可追溯到清宣统二年（1910年）。1999年，两校合并组建成新昆明理工大学。2004年，云南省分析测试中心并入。
3、云南师范大学
云南师范大学前身是诞生于1938年的国立西南联合大学师范学院。1946年，组成西南联大的北京大学、清华大学、南开大学三校复员北返，其师范学院留昆明独立建校，定名国立昆明师范学院。
1950年改名昆明师范学院，1984年更名为云南师范大学，1999年，与云南教育学院、云南体育进修学院合并重组云南师范大学。2000年8月，云南银行学校并入云南师范大学。
4、云南农业大学
云南农业大学（Yunnan Agricultural University，YAU），简称“云农大”，坐落在春城——云南省昆明市，为云南省属重点大学，入选国家卓越农林人才教育培养计划和卓越工程师教育培养计划。
是全国第二批深化创新创业教育改革示范高校、全国创新创业典型经验高校、国家“2011计划”建设单位、中国政府奖学金来华留学生接收院校，具有研究生推免资格高校，拥有博士学位和硕士学位授予权，设有中国—东盟教育培训中心。
5、昆明医科大学
昆明医科大学（Kunming Medical University），位于云南省昆明市，简称“昆医大”，是云南省最大的集教学、医疗、科研为一体的高等医学院校。
是国家“中西部高校基础能力建设工程”重点建设高校、云南一流学科建设高校，入选教育部“卓越医生教育培养计划”试点、国家级大学生创新创业训练计划，是云南省国际医学人才培养基地，南亚东南亚医学教育与医疗卫生联盟发起成员。
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