法律分析：1、二者行政级别有区别：
派出所所长应该是乡科级副职或股级正职干部；县区公安局局长是乡科级正职领导干部。
2、二者权限有区别。主要是：
（1）公安派出所是公安局的派出机构，派出所要服从所在公安局的领导，当然派出所所长要接受公安局局长的领导；
（2）派出所一般不能以自己的名义对行为人进行处罚（少数治安案件除外），但公安局可以以自己的名义独立办理治安案件和刑事案件，可以依法对行为人做出处理；
也就是说，公安局长的职责与权限，比派出所长要大的多。
3、二者岗位职责有区别：
派出所所长负责主持派出所的全面工作。
法律依据：《中华人民共和国人民警察条例》
第七条 中华人民共和国公民身体健康、具备一定的文化程度、自愿充任人民警察的，经县、市以上公安机关审查合格后，可以充任人民警察，但是被剥夺政治权利的人除外。
第八条 国家按照人民警察的现任职务、政治品质、业务能力和对革命事业的贡献，评定等级。
第九条 人民警察执行职务有卓越成绩的，分别给予表扬、物质奖励、记功、提前晋级、授予国家的奖章、勋章和荣誉称号等奖励。
第十条 人民警察必须遵守规定的纪律。对违反纪律和失职的人员，可以分别情节给予警告、记过、禁闭、降级、降职、撤职等纪律处分。