法律分析：（1）司法机关和行政机关都由人民代表大会产生，而这之间没有隶属关系，但存在着监督与互相支持工作的关系。
（2）行政机关主要包括各级人民政府及其职能部门，而司法机关则主要由各级人民法院和检察院构成。至于公安局的性质比较特殊，当其在依据行政法律规范执行行政管理职能时，被认定为是行政机关，而当其依据刑事法律规范行使刑事侦查职能时，被认定为是司法机关。
（3）行政机关行使的是行政管理职权，而司法机关中法院依法行使审判职权，检察院依法行使法律监督职权和一定范围内的刑事侦查职权，公安机关依法行使部分刑事侦查职权。
（4）行政机关实行首长负责制，而司法机关中法院和检察院则实行集体负责制。
法律依据：《司法部关于加强司法所建设的意见》 第二条 努力创造条件，积极组建司法所
当前，政府机构改革工作正在省、地（市）、县、乡镇（街道）展开，给司法所建设提供了有利的机遇。地方各级司法行政机关特别是县区司法局应抓住这个有利时机，积极争取当地党委和政府的重视和支持，力争把司法所建设列入政府的机构改革方案；主动与编委、人事、财政等有
关部门疏通、协商，解决司法所的机构编制和财政保障问题，积极、稳妥地加速组建司法所工作的进程。
司法所应当建成县区司法局在乡镇人民政府（街道办事处）的派出机构，是承担乡镇人民政府（街道办事处）管理司法行政工作的职能部门，在县区司法局和乡镇人民政府（街道办事处）领导下进行工作。