土地确权亩数少了处理方法如下：1、农民发现问题之后及时提出来，不要当场签字，因为一旦签字就生效了。可以向工作人员提出要求，重新测量，确定登记的亩数和丈量的面积是相同的，要以实际丈量为准。如果没有得到解决，可以通过向当地人民政府提起诉讼要求，再重新丈量土地或者
宅基地，直到面积正确为止。
2、如果丈量面积是正确的，就可以签字，能够生效。如果没有得到解决，可以通过向当地人民政府提起诉讼要求，再重新丈量土地或者宅基地，直到面积正确为止，你才可以签字，最后才会颁发确权书。
3、如果实际面积确实少了，也可以采取后期补偿的方法。当地政府能补足就补足，如果集体无法调整，可以不调整，维持现状。农民朋友需要知道拿起法律的武器保护自身的权益，如果发生了纠纷，先通过协商解决，协商不成，再通过人民政府调解决。实在不行，再申请仲裁，向人民法院起诉。