摩托车排气管进水后，处理办法因进水程度而异。以下是不同进水程度下的处理方法：
少量进水：当摩托车排气管仅少量进水时，随着车辆持续使用，积水会逐渐随废气排出，不会对车辆和发动机造成明显不良影响。
进水严重：
（1）首先检查高压冒是否潮湿，如潮湿需擦干。随后将火花塞拆下插到高压冒上，把火花塞粗的那头放在缸头上，进行电启动。
（2）如火花较弱或没有，应重点检查电路，可将摩托车置于阳光下暴晒或使用高压气体吹干。
（3）若火花较强，证明电路无问题，此时需检查排气管、空气滤清器、化油器、汽缸等部件。
（4）如发动机进水，需放掉原汽油并彻底清洗发动机内部。