观音菩萨似乎对孙悟空格外“偏爱”，如果我们仅仅从《西游记》角度来分析，而不牵扯到佛教中的观世音菩萨信仰，就要从两方面来着眼：一是观世音菩萨和孙悟空的关系；二是唐僧取经和观音菩萨的关系。
我们先分析观音菩萨和孙悟空的关系。在孙悟空大闹天宫之际，观音菩萨曾到天庭向玉帝举荐二郎神杨戬对付孙悟空。这一建议被采纳，而且也发生了作用果，孙悟空被天庭擒拿。观音菩萨为什么不自己出手降伏孙悟空呢？这可以说是“洞悉因果”的观音菩萨有意为之，为日后和孙悟空之间的关系埋下伏笔。
在《西游记》中，孙悟空一直称呼观音菩萨为“菩萨”，但实际上，观音菩萨是孙悟空的师父，确切说，是孙悟空的剃度师。这一点在原著中也有明确描述。观音菩萨由西向东前往东土大唐寻找取经人的时候，先后遇见沙和尚、猪八戒和孙悟空，并一一为他们剃度、摩顶受戒。从佛家仪轨而言，观音菩萨就是他们的剃度师。后来他们三位跟随唐僧，也就是修行以唐僧为榜样，诸般行为都要以唐僧唯命是听。这在佛家而言，就是皈依师，也叫依止师。
不光是孙悟空，猪八戒和沙和尚同样也是如此。作为师父，徒弟犯错，师父出面训斥调教并积极善后；徒弟有难的时候，出面相助，这是师父的责任。所以观音菩萨帮孙悟空是为师的本分。
相比于猪八戒和沙和尚，观音菩萨唯独只给了孙悟空三根救命毫毛。从表面上看，这确实是菩萨偏心。背后的原因则是观音菩萨自然知道，这一路上，本领最大，出力最多的是孙悟空。让强者更强远比提升一个团队的平均战斗值更有实效。另一方面，唐僧和孙悟空是“身心”不可分的整体，增强孙悟空的本领，就是增加完成任务的保障系数。
另一方面是唐僧取经和观音菩萨的关系。唐僧取经的任务，是如来佛祖亲自安排，并下法旨让观音菩萨负责挑选取经人等诸事宜。所以说唐僧取经对观音菩萨而言就是自己分内的事情。为保证这一任务的顺利完成，观音菩萨在“有求必应”的大慈大悲之上，更是尽力帮助孙悟空——帮孙悟空，就是帮唐僧，这一点不论是菩萨、孙悟空还是我们读者都是非常明白的事情。
孙悟空的原型，有多重来源。其中有印度神话神猴哈奴曼的影子。而观音菩萨和神猴之间也有着渊源。我们曾分析过唐僧师傅四人是一个整体，如果重将他们师徒四人重叠，就又会发现他们可以说是观音菩萨的某种示现或化身。从这样一个角度而言，取经人就是观音菩萨。师徒四人中，象征“心”的孙悟空，自然是观音菩萨最为关注的。因为也只有在这个层面上，才是分身或自性的示现。
综合上述，我们也就不难理解为什么在《西游记》中，观音菩萨对孙悟空格外偏爱的原因了。