汕头市农业局根据其职能设有多个内设机构，包括：
办公室（兼应急管理办公室）：负责机关日常工作，如文电、会务、档案管理，以及信息、安全、保密、信访、新闻宣传等工作。同时，处理重要文件起草和行政审批综合办理，制定并执行相关规章制度，参与应急管理工作。
综合协调科：协调农业部门间的合作，处理“三农”难题，审核涉农政策建议，推进对外交流与合作，负责农业招商和农产品出口基地建设，组织农业展览等活动。
政策法规科：研究重大社会问题，提出农村发展战略和政策建议，负责行政执法监督和规范性文件审核，处理行政复议和法律咨询等事务，起草地方性法规和规章，推动法制宣传教育和培训。
发展计划科：负责农业经济发展计划制定，管理农业项目，组织农业资源区划，进行农业统计，协助农业综合开发项目等工作。
农村经营管理科（农村经济组织管理科）：研究农村经营制度，处理土地承包、流转和纠纷，监督农民负担，指导农村经济组织发展和农村集体资产管理工作。
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科技教育科：负责农林业科技发展规划，推广技术，引进优良品种和技术，管理科技成果，组织农民技术职称评定，参与农业教育培训。
财务科：负责资金计划、预算、决算管理，专项资金申报和审计，农业林业事业费及林业基金管理，监督直属单位资产。
人事科（老干部管理科）：负责人事管理、专业技术资格评审和离退休人员服务。
监察室（与直属机关党委办公室合署）：负责机关和直属单位的监察、纪检和党群工作。
扩展资料[1] 根据《中共汕头市委、汕头市人民政府关于印发的通知》（汕发〔2009〕14号），设立汕头市农业局（加挂市委农村工作办公室、市林业局牌子），为市政府工作部门。