小智的神奇宝贝队伍经历了多次变化，他的伙伴们各具特色，共同经历了许多冒险。以下是小智的神奇宝贝列表，按照它们首次出现的顺序排列：
1. 皮卡丘（EP001）：电气属性，静电特性，是小智最初的伙伴，性格顽强，实力出众。
2. 稚更鸟（XY003）：一般+飞行属性，鸽胸特性，曾抢夺电仓鼠的果子，后被小智收服。
3. 妙蛙种子（EP010）：草+毒属性，茂盛特性，曾守护神奇宝贝乡，是小智手中最久的神奇宝贝之一。
4. 小火龙（EP011）：炎属性，猛火特性，曾被另一位训练家抛弃，后加入小智的队伍。
5. 大钳蟹（EP013）：水属性，怪力剪刀/贝壳盔甲特性，在海边被小智收服。
6. 肯泰罗（EP035）：一般属性，愤怒穴道/威吓特性，野生原野区收服的神奇宝贝，喜欢成群快速奔跑。
7. 卡比兽（EP095）：一般属性，免疫/肥含败脂特性，大胃王，特别擅长游泳。
8. 赫拉克罗斯（EP120）：虫+格斗属性，毅力/预感特性，曾保护巴大蝴，性格温顺。
9. 菊草叶（EP127）：草属性，茂盛特性，特别喜欢小智，曾妒忌皮卡丘。
10. 火球鼠（EP142）：炎属性，猛火特性，擅长躲避攻击，悠哉悠哉的性格。
11. 小锯鳄（EP152）：水属性，激流特性，活泼好动，喜欢跳舞。
12. 猫头夜鹰（EP155）：一般+飞行属性，失眠/锐利目光特性，智商高，负责空中搜查工作。
13. 小小象（EP231）：地面属性，结实特性，喜欢玩耍，后进化为顿甲。
14. 傲骨燕（AG004）：一般+飞行属性，毅力特性，原先是群落首领，后被小智收服。
15. 木守宫（AG007）：草属性，茂盛特性，叛逆性格，喜欢叼树枝。
16. 龙虾小兵（AG023）：水属性，怪力剪刀/贝壳盔甲特性，海边的捣蛋鬼，后被小智收服。
17. 煤炭龟（AG058）：炎属性，白色烟雾特性，曾被钢系神奇宝贝袭击，后被小智指导打败大钢蛇。
18. 雪童子（AG108）：冰属性，冰冻身体/精神力特性，偷走小智的徽章盒，后被小智保护并收服。
19. 姆克儿（DP002）：一般+飞行属性，锐利目光/威吓特性，原先是群落首领，后被小智收服。
20. 嫩叶龟（DP005）：草属性，茂盛特性，擅于处理神奇宝贝纠纷，后被小智收服。
21. 小火猴（DP051）：炎属性，猛火特性，原先是真司的神奇宝贝，后被小智收服。
22. 叉尾浮鼬（DP055）：水属性，轻快特性，贪吃，喜欢神奇宝贝对战，后被小智收服。
23. 天蝎（DP064）：地上+飞行属性，怪力剪刀/沙里隐身特性，贪吃，喜欢神奇宝贝对战，后被小智收服。
24. 圆陆鲨（DP157）：龙+地上属性，沙里隐身特性，被小智帮助找到天龙流星的感觉，后成为小智的伙伴。
25. 豆豆鸽（BW002）：一般+飞行属性，鸽胸/强运特性，是小智在合众地方收服的第一只神奇宝贝。
26. 小球獭（BW003）：水属性，激流特性，顽皮，喜欢表现自己，常自动从精灵球里跑出来。
27. 暖暖猪（BW004）：炎属性，猛火特性，被前任训练家抛弃后，决定跟随小智去旅行。
28. 叶腾蛇（BW007）：草属性，茂盛特性，个性强硬，大姐头的作风。
29. 滑头小子（BW017）：恶+格斗属性，蜕皮/自信过剩特性，性格非常要强，喜欢用头槌攻击旁边的人。
30. 虫宝包（BW018）：虫+草属性，预感/叶绿素特性，一开始小智收服不到它，后来舍身救下虫宝包，最后随小智一起旅行。
31. 蓝蟾蜍（BW032）：水+地上属性，轻快/毒手特性，实力强悍，曾在东·乔治对战大会中击败赤霞珠的长毛狗和迪诺的火红不倒翁。
32. 石丸子（BW034）：岩石属性，结实特性，小智派出水水獭和暖暖猪想收服，但失败，后与暖暖猪进行战斗。
33. 黑眼鳄（BW003）：地上+恶属性，威吓/自信过剩特性，一开始与小智的皮卡丘有劲敌意识，后进化成混混鳄，再进化成流氓鳄。
34. 杰尼龟（EP012）：水属性，激流特性，曾制造许多麻烦，后成为杰尼龟消防队。
35. 猴怪（EP025）：格斗属性，愤怒穴道/元气特性，曾为了追回帽子，小智与它战斗，并收服了它。
36. 绿毛虫（EP003）：虫属性，磷粉特性，小智第一个收服的神奇宝贝，喜欢小霞，但小霞却讨厌虫。
37. 比比鸟（EP003）：一般+飞行属性，锐利目光/蹒跚特性，小智收服的第二只神奇宝贝，也是第一只飞行系神奇宝贝。
38. 乘龙（EP085）：水+冰属性，后野放。
以上是小智在神奇宝贝冒险中收服或遇到的主要伙伴们，它们陪伴小智经历了无数的挑战和成长。
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