一、АВФ — Азовская Bоенная Флотилия 亚速海区舰队1770年成立，最早是1768年建立的顿河小舰队，1771年初拥有帆桨平底战船10、武装平底船5、炮舰2、小型桨船100余艘。1918年4月再次建立，同年6月撤销；1920年3月再建，5月编入里海－亚速海军，秋季拥有炮舰9、浮动炮台4、驱潜艇22、布雷舰3、护卫艇6、船25、飞机18，1921年4月撤销。1941年7月再建，此时拥有炮舰3、护卫舰5、扫雷艇7、飞机9，1942年10月撤销；1943.2.3再次成立，43.4拥有护卫艇3、装甲艇12、鱼雷艇2、半滑艇22、扫雷艇7；43年中有装甲艇49，猎潜艇22，炮艇2，火箭炮艇3，鱼雷艇12，炮舰10，浅水重炮舰1，浮动炮台1，护卫艇、扫雷艇、登陆艇等100多艘；1944年4月在其基础上建立多瑙河区舰队。二、АВФ — Амурская Bоенная Флотилия 阿穆尔河区舰队，1906年7月成立，到1910年拥有舰船28艘（浅水重炮舰8、炮舰10、船10）。1917年12月再建，18年9月7日被日军获全部舰船仅余一艘炮舰“奥罗奇人”号。1920年5月重建，拥有武装轮船4；1921夏拥有浅水重炮舰3、炮舰3、武装汽船4；1923年拥有浅水重炮舰3、炮舰2、布雷舰1等；1929年拥有浅水重炮舰、炮艇、装甲艇14，扫雷舰1个中队，飞机14、海军陆战营1。
二战爆发后，区舰队实力不断加强，1944年拥有舰艇200艘（浅水重炮舰8、炮舰11、装甲艇52等）；1945年8月拥有1.25万人，装备浅水重炮舰8、炮舰11、水雷艇7、装甲艇52、扫雷舰12、扫雷艇36、岸炮199、飞机68等。三、АВФ — Амудaрьинская Bоенная Флотилия 阿姆河区舰队，1877年建立，1918年7月撤销；1920年2月重建，拥有炮艇10、快艇2等，同年4月12日并入咸海区舰队。四、АВФ — Аpaльская Bоенная Флотилия咸海区舰队，1853年建立，1880年拥有武装轮船6、辅助船9等，1883年撤销；1919年夏天再建，拥有船10余艘，20年11月撤销。五、AКФ — Acтpaxaнo Kacпийcкaя Флотилия 阿斯特拉罕－里海区舰队，1918年10月建立，11月拥有舰艇50、飞机6；1919年夏拥有舰船100（
驱逐舰6、护卫舰3、潜艇4、浮动炮台4、武装汽船10、驱潜艇7等）、飞机8，3000人；7月编入伏尔加河－里海区舰队。白军此时估计区舰队拥有驱逐舰与鱼雷艇11、潜艇4、巡逻舰艇17、汽艇8、帆船4。六、БВФ — Бeлoмopcкая Bоенная Флотилия白海区舰队于1693年成立，1694年有了3艘军舰。20年3月1日再次成立，4月25日改为北海海军，拥有驱逐舰2、猎潜艇1个中队、扫雷舰12、通信船1、测量船7等，22.解散。1941年8月成立白海区舰队，辖有驱逐舰护卫舰大队、布雷舰大队、扫雷支队各1，舰艇100多艘。七、БВФ — Бaйкальская Bоенная Флотилия
贝加尔湖区舰队，1918年6月建立，快艇1、船3，8月自沉全部舰船；1919年12月建立护卫舰支队，1921年2月改为区舰队－舰船来自撤编的西伯利亚区舰队与叶尼塞河区舰队，1922年5月撤销。八、ВВФ — Волжская Bоенная Флотилия 伏尔加湖区舰队，1918年6月建立，9月拥有驱逐舰3、武装汽船5、浮动炮台4、小艇4、飞机4，10月沃利斯克区舰队并入，1919年6月有炮舰20、护卫舰6、浮动炮台1、飞机9，7月21日编入伏尔加河－里海区舰队。1941年10月重建，1942年7月
斯大林格勒会战爆发时有炮艇7、装甲艇14、扫雷艇33、浮动炮台2，在
斯大林格勒战役中歼敌3个多团，毁敌坦克48、飞机16、火力点100，1944年6月30日撤销。九、ВKВФ — Волжскo－Kacпийская Bоенная Флотилия伏尔加河－里海区舰队，1917年7月21日由原阿斯特拉罕－里海区舰队和伏尔加河区舰队合并组成，1919年8月拥有舰艇200多（辅助巡洋舰3、驱逐舰6、旧式驱逐舰3、潜艇4、炮舰38、护卫舰24、浮动炮台6、船90等），年底从波罗的海舰队调入驱逐舰7、护卫舰6，1920年7月改名为里海舰队。十、ДВФ — Дунайская Bоенная Флотилия 多瑙河区舰队，1771年建立，1774撤销；1787再建，1877年拥有水雷艇15、蒸汽船6、桨船20余艘，1879年撤销。1917年11月重建，1918年2月由比萨拉比亚撤退到敖德萨，3月所有舰船被德国俘获。1940年6月再建，1941年6月有浅水重炮舰5、装甲艇22、扫雷艇7、护卫艇30、半滑艇6，同年11月20日撤销。1944年4月重建，拥有江河舰艇独立支队1（装甲艇14、炮艇18、扫雷舰艇22）、装甲艇支队1（装甲艇36）、半滑艇队1（半滑艇16）等。44.10组成江河舰艇第一支队（浅水重炮舰3、装甲艇35）、江河舰艇第二支队（浅水重炮舰3、装甲艇16、水雷艇16）、扫雷支队（扫雷艇36）。十一、ДВФ — Дoнская Bоенная Флотилия顿河区舰队，1733年建立，1735年拥有船79－大平底船9、小平底船6、大桡木船35、轻快划船29，1739年撤销；1768年重建，有船132，1783年撤销。1919年3月再建，350人，8月撤销；1920年3月再建，改名顿河－亚速海区舰队，船17，1921年6月撤销。1941年10月重建，1942年7月撤销。十二、ДнВФ — Днепровская Военная Флотилия 第聂泊河区舰队，1735年建立，小船657，1739年撤销。1919年8月建立，1920年春天拥有舰艇40（炮舰18、护卫舰10、装甲艇4等），同年12月撤销。1931年6月再建，舰船120多，1940年6月撤销。1943年9月重建，1944年春天拥有舰艇140（装甲艇16、护卫艇10、扫雷艇40、浮动炮台1等），1945年5月撤销。十三、EВФ — Eниceйская Bоенная Флотилия叶尼塞河区舰队，1920年1月利用在克拉斯诺亚尔斯克缴获舰船组成，同年4月编入西伯利亚区舰队。十四、ЗДВФ — Зaпaднo－Двинская Bоенная Флотилия西德维纳河区舰队，1919年11月建立，几艘装甲艇，1920年11月撤销。十五、ИВФ — Ильмeнская Bоенная Флотилия伊尔门湖区舰队，1941年7月28日建立，炮舰3及几艘艇，同年10月20日撤销。十六、KBФ — Kacпийская Bоенная Флотилия里海区舰队，1722年11月建立，1781年重建，到1794年拥有三桅炮舰3和小舰24，20世纪初拥有炮舰2、武装汽船3。1918年4月再建，原为阿斯特拉罕边疆区舰队，1918年10月13日并入阿斯特拉罕－里海区舰队（此时有舰艇68），1931年6月27日改为里海区舰队，1945年4月27日荣获红旗勋章。十七、Ладожcкая озеро Bоенная Флотилия拉多加湖区舰队，1939年10月建立，1940年11月改为训练支队。1941年6月25日重建，8月拥有舰艇66；在1941－1943年作战中损失炮舰“奥列克马”，扫雷舰Tш－122，救生船“潜水员”号，另小艇船124（5万吨），1944年11月4日撤销。十八、OBФ — Oнeжcкая Bоенная Флотилия奥涅加湖区舰队 1918年6月建立，1919年夏天拥有驱逐舰2、护卫舰2、炮舰8、布雷舰2、护卫艇12、浮动炮台2等，1920年3月撤销。1941年8月7日再次成立，由5艘由拖船改装的炮艇，人数500人，同年11月28日撤销；1942年4月成立了奥涅加湖舰艇队，有1个炮舰大队－7艘，1个装甲艇大队－8艘，1个扫雷艇大队－5艘，护卫舰4及辅助舰船，后再编入1个76毫米浮动炮台，同年12月该舰艇队编入区舰队，1944年7月10日撤销。十九、OФ — Oxoтcкая Флотилия鄂霍次克区舰队，1731年建立，1750年有船7（小船3、平底帆船3、两桅帆船1），1850年拥有舰船11（运输船4、小艇2、小帆船5），1856年改名为西伯利亚区舰队。二十、ПВФ — Пинская Военная Флотилия 平斯克区舰队，1940年6月建立，40.1准备建造9艘浅水重炮舰和85艘装甲艇，其中大部分用来装备该舰队，西方资料称41.6拥有浅水重炮舰9、炮艇8、巡逻艇9、摩托炮艇16、扫雷艇14等。1941.7.16－9.15作战损失5艘浅水重炮舰（Vinnitsa、Zhemchuzhin、Bobruisk博布鲁伊斯克、Zhitomir日托米尔、Smolensk斯摩棱斯克），41.9.18在基辅自沉4艘浅水重炮舰（Levachev、Flyaghin、Rostovtsev、Vitebsk维捷布斯克），41.9.1－9.18在第聂伯河沉没巡逻艇6、炮艇2，41年10月5日撤销。1943年秋季，重新组建，改名为第聂伯河区舰队。二十一、ПФ — Пpипятская Флотилия普里皮亚季河区舰队，1919年7月建立，汽船12、武装汽船5，后增加装甲艇2，同年9月26日编入第聂伯河区舰队。二十二、CВФ — Cибиpская Bоенная Флотилия西伯利亚区舰队，1856年建立，由原鄂霍次克区舰队改名，到1866年拥有舰船43（巡洋舰3、炮舰13、运输船4、轮船18等）。1910年拥有巡洋舰2、驱逐舰2个大队、潜艇13、炮舰1、布雷舰2、运输船8等。
一战时拥有巡洋舰7、驱逐舰9、小型驱逐舰15、潜艇3，1918年7月被掠走小型驱逐舰14及辅助船；1919年12月再建，拥有炮艇3、炮舰4、装甲艇2 、快艇8，1921年2月撤销，改名为远东共和国海军。二十三、CВФ — Cыpдapьинская Bоенная Флотилия锡尔河区舰队，1922年5月建立，护卫舰10等，同年6月撤销二十四、CTВФ —Ceвepная Tиxooкeaнская Bоенная Флотилия北太平洋区舰队，1939年8月建立，1945年8月拥有护卫舰1、扫雷舰9、潜艇17、鱼雷艇49、护卫艇24、扫雷艇4、飞机280，同年9月撤销。二十五、Чyдская Bоенная Флотилия — 楚得湖区舰队，1915年建立，1917年撤销；1918年4月再次建立，1919年撤销。1941年7月3日重建，武装船6、小船5，8月13日主要舰船战沉，8月27日撤销。