种子经营许可证应当注明许可证编号、经营者名称、经营者住所、法定代表人、申请注册资本、有效期限、有效区域、发证机关、发证时间，种子经营范围、经营方式等项目。
许可证编号为“（X）农种经许字（XXXX）第X号”，第一个括号内为发证机关简称，第二个括号内为年号，号码为顺序号；经营范围按作物种类和杂交种或原种或常规种子填写，经营范围涵盖所有主要农作物或非主要农作物或农作物的，可以按主要农作物种子、非主要农作物种子、农作物种子填写；经营方式按批发、零售、进出口填写；有效期限为5年；有效区域按行政区域填写，最小至县级，最大不超过审批机关管辖范围，由审批机关决定。