蚯蚓粪有机肥与普通有机肥使用方法类似。
基肥（底肥）施用
基肥，一般叫底肥，是在播种或移植前施用的肥料。在翻耕时，将有机肥均匀施入，随着翻地将肥料翻入土中，这种方法简单，易操作，能够起到很好的改良土壤的目的，但于其均匀施入土壤，不能全部甚至大部分接触根系从而被根系利用，因此，肥料利用率这势必造成多余的浪费，带来一定的经济损失，其次也容易产生土壤障碍。因此该方法比适合于种植密度大的作物。
追肥施用
有机肥用作追施的方法有土壤深施和根外追肥两种。土壤深施一般将有机肥施在根系密集层附近，施后覆土，以免造成养分挥发损失。根外追肥是将堆肥与10倍的水混合均匀，静置后取其上清液，借助喷雾器将肥料溶液喷洒在作物叶面，以供叶面吸收。
用作种肥
种肥的使用方法有多种，如拌种、浸种、条施、穴施等。拌种是用少量的清水，将有肥溶解或稀释，喷洒在种子表面，边喷边拌，使肥料溶液均匀地沾在种子表面，阴干后播种的一种方法。浸种是把肥料溶液溶解或稀释成一定浓度的溶液，按液种1:10的比例，把种子放入溶液中浸泡12~24h，使肥料液随水渗入种皮，阴干后随即播种。开沟或挖穴后将肥料施入耕层3~5cm的沟、穴中，再在肥带附近播种，种肥距保持在3cm以上。用作种肥肥料要求养分释放要快，不能过酸、过碱，肥料本身对种子发芽无毒害作用，堆制后充分腐熟的有机肥是很好的种肥。
用作育苗肥
充分腐熟的有机肥料，分释放均匀，养分全面，是育苗的理想肥料。一般以10%的发酵充分的发酵有机肥料加人一定量的草炭、蝇石或珍珠岩，用土混合均匀做育苗基质使用。
蚯蚓粪含有高度活性的细菌和酶，植物残余物和动物粪便残余物以及蚯蚓卵（潮湿）的生物混合物。这些粪含有丰富的水溶性植物营养物质，比表层土壤中含有的腐殖质还多50％以上。
蚯蚓粪里充满了植物生长所必需的矿物质，如浓硝酸盐，磷，镁，钾和钙。它还含有锰，铜，锌，钴，硼，铁，碳和氮。然而，最好的是，这些矿物质可以立即用于植物，没有任何烧根的风险。请记住，动物粪便有机肥和化肥必须在植物吸收之前在土壤中分解。
当有机物质通过蚯蚓的消化道时，在粪上沉积一薄层油。这层油会在2个月的时间内被侵蚀。尽管植物营养物质可以立即使用，但它们缓慢释放持续时间更长。蚯蚓粪中的茧每个包含2到10个在2周内孵化的卵。这意味着年轻蚯蚓持续分解土壤有机质过程，只要土壤松散，潮湿和有机物质丰富，蚯蚓就能活下来。
蚯蚓消化道内的细菌将有机废物转化为天然肥料。有机废物经历的化学变化包括除臭和中和。这意味着蚯蚓粪的pH值是中性，蚯蚓粪粪是无臭的（雨后它们闻起来就像一片森林里的味道）。蚯蚓的粪也含有细菌，当这个过程在土壤中继续进行，微生物的活动得到促进。
有机肥来源的肥料对植物和土壤都有好处，如果使用得当，一般不会燃烧或损坏植物。有机肥料刺激土壤微生物繁殖，改善土壤结构。土壤微生物在将有机肥料转化为可被植物吸收的可溶性养分方面起着重要作用。有机肥料通常提供次生和微量营养素的需要，通常在化学肥料中却没有。
有机肥料氮、磷、钾的来源比化学肥料相对较低，但是可以保持土壤肥力更持久一些。因此，有机肥对植物的影响通常是更微妙的。假如有机肥应用到草坪，它可能需要一段时间才能看到结果，但回报是草坪保持绿色的时间。
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可作为粮食、蔬菜、果树、瓜类及园林绿化的基肥和追肥施用。
2
与长效化肥配合使用效果更加显著。
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该肥对作物绝对安全，可与种子或幼zd苗直接接触不会产生任何危害。
注意事项：
1.最好不要施用于土壤表面，以免太阳光直接照射影响微生物活性及养分挥发。
2.宜存放阴凉、干燥处，谨防老鼠咬食。产品特点：
蚯蚓粪是一种黑色、均一、有自然泥土清香的细碎类物质，具有良好的持久肥力、通气性、排水性和保内水性。养分全面，是各类花卉最理想的肥料。具有单一使用绝不烧根的特点。
1.蚯蚓粪富含极易被植物吸收的各类养分，肥力充足持久。
蚯蚓粪不仅含有氮、磷、锌等各类元素，而且含有铁、锰、锌、铜、镁等多种微量元素和18种氨基酸，有机质含量和腐植质含量可达30%左右。
2.蚯蚓粪中含有大量的有益微生物、氨基酸。
蚯蚓粪每克含微生物有益菌群约1亿，更可贵的是含有拮抗微生物和未知的植物生长素。
3.唯一的天然团粒、吸附性结构肥料。
蚯蚓粪是最好的亲水性和吸附性花卉肥料。使用过的花卉土壤不会存在板结的现象，而且保肥保湿效果好。独特的疏容松、多孔结构对吸收室内甲醛、苯、挥发性有机化合物有神奇的作用。
蚯蚓粪追肥