农业银行限额5000的解除方式主要有以下几种：
1. 网上银行修改：用户可以登录农业银行网上银行，在个人账户中找到支付限额设置，选择合适的修改方案，修改后即可解除限额5000的限制。
2. 手机银行修改：用户可以下载农业银行手机银行APP，通过手机号和验证码登录后，在个人中心中找到支付限额设置，进行相应的修改操作。
3. 前往银行柜台修改：用户可以携带身份证和农业银行卡前往农业银行柜台，向工作人员提出解除限额5000的申请，根据工作人员提示进行操作即可。
需要注意的是，不同的用户类型和交易方式可能会有不同的限额标准和修改方式，用户在进行操作时需要根据自己的具体情况选择相应的解除方式。同时，为了保障资金安全，用户在解除限额时也需要注意保护好自己的账户信息和交易密码，避免遭受损失。