如果本科毕业论文被省教育厅抽检不合格，学校通常会采取以下措施：
联系学生：首先，学校会与学生本人联系，了解论文的情况和不合格的原因。学生需要提供详细的解释和说明，并说明是否需要重新提交论文或参加补考。
讨论解决方案：在学校和学生共同商定的情况下，可以制定一些解决方案，例如提供额外的指导或支持，或者重新安排论文提交的时间。
修改论文：如果抽检不合格的原因是论文质量不达标，学生需要重新修改论文，并按照学校的规定重新提交。
取消毕业资格：如果学生无法在规定的时间内重新提交论文，或者重新提交的论文仍然不符合要求，学校会取消该生的毕业资格。
每个学校的规定以及具体做法都不同，如果毕业论文被抽检不合格，请尽快与学校联系，并严格遵守学校的要求和安排。