如果股东转让的股权价值为100万元，那么应该支付的印花税为500元。
股东转让股权的印花税税率，根据中国的税法规定，为交易金额的万分之五。这意味着，如果股东转让的股权价值为100万元，那么应该支付的印花税为500元。
拓展资料：
印花税是对经济活动和经济交往中订立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。股东转让股权需要缴纳印花税，税率根据转让形式不同而有所差异。
如果股东以货币资金出资，无须缴税。被投公司须缴纳印花税，计税依据为“实收资本”与“资本公积”两项的增加值，适用税率为万分之五。
如果股东以非货币资产出资，根据资产类型，可能涉及印花税、增值税、土地增值税、个人所得税等。比如，股东以房产入股，即以不动产换取股权，属于有偿转让房产的行为。根据相关法规，股东须缴纳增值税、土地增值税等。
另外，转让双方依据转让金额缴纳印花税，适用税率为万分之五。通常情况下，个人股东取得公司现金分红，须按“股息、利息、红利所得”缴纳个人所得税，适用税率20%。同时，股东按正常转让缴纳印花税。
总之，股东转让股权时需要按规定缴纳相应的税费。如有疑问，建议咨询专业税务人员或法律顾问。