法律分析：如果债务人借债不还的，当事人协商无效的，债权人有权向人民法院提起诉讼，请求人民法院判决债务人偿还债务。所以，员工借公司的钱不还的，公司在协商无效的情形下，公司有权通过诉讼方式要求员工还钱，但是否提起诉讼，由公司自行根据实际情况进行决定。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》
第三条 人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。
第二十一条 对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。 对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。