耳鼻喉诊疗中心
山东省耳鼻喉微创诊疗中心是山东省交通医院重点科室之一，山东省交通医院自建院以来，耳鼻喉诊疗中心一直是山东省交通医院重点建设的品牌特色学科。作为重点耳鼻喉科实力的国家公立三级医院、山东省医保定点医院、新农合定点医院、山东大学教学医院，耳鼻喉诊疗中心以微创诊疗为特色，获得国家顶尖医疗力量的强有力支持，经过十余年优势积累，医院在耳鼻喉微创诊疗方面建立了无可比拟的优势。
山东省血栓病防治工程技术研究中心
山东省血栓病防治工程技术研究中心 是经山东省科技厅批准成立的集血栓性疾病的诊断、治疗、预防等方面的研究及生产、开发、销售为一体的省级科研机构，“血栓危险度判断系统”获国家发明专利，并获“中国青年科技博览会金奖”，中心于1994年开始参与国家863计划课题“基因重组溶栓药物的研制”，在国内外首先建立了“猪脑梗塞动物模型”，并将其应用到国家一类新药“基因重组链激酶”和“基因重组葡激酶”治疗脑梗塞的药效学研究，中心取得了10多项具有国际先进水平和国内领先水平的科研成果，在国内外学术刊物发表论文30余篇，为10000余例血栓性疾病患者提供了正确的诊断和有效的治疗，中心将临床医疗与科研开发并重，先后研制出“血栓形成分子标记物系列诊断试剂盒”和治疗血栓性疾病的中药“健瘫灵”系列，已经在省内设立7家分中心，与省内外12家医疗机构建立了协作关系，使该项技术得到了很好的推广和应用。2000年,该项目被山东省卫生厅列为省级继续医学教育项目之一。
肝胆内镜外科治疗中心
肝胆内镜外科治疗中心 自1992年以来率先在省内应用EPT技术治疗胆道结石，已经为4000余例病人进行了ERCP检查，成功率为99.7%，实施EPT术2000余例、成功率100%；配合经内镜胆总管机械碎石术、胆道子母镜双频激光碎石术使各种肝外胆管结石的取净率达98.2%；开展胆道支架置入技术，为200余名胆道梗阻或狭窄病人解除了痛苦；应用纤维胆道镜配合液电碎石治疗肝内胆管巨大嵌顿结石，成功率超过97%。1992年12月ERCP、EPT、胆道子母镜的临床应用研究三项科研课题通过了国内专家鉴定，前两项为省内领先，并达到国内先进水平，后一项为国内领先，并达到国际先进水平。该中心先后获得山东省科技进步二、三等奖各一项。中心不断发挥内镜治疗的优势，开展了腹腔镜治疗技术，逐步扩大内镜诊疗的适应症，减轻了病人的痛苦，提高了治愈率，减少了住院时间，在省内外赢得了较好的社会信誉。该项目被山东省卫生厅列为省级继续医学教育项目之一。
神经康复中心
神经康复中心 是1998年我院与中国康复研究中心协作成立的我省首家治疗偏瘫、截瘫、脑瘫的康复治疗中心，在中国康复研究中心专家教授的指导下，根据国际上先进的神经康复理论，先后建立了运动治疗室、作业治疗室、言语治疗室、功能性电刺激治疗室、神经心理测验室及针灸理疗室等，中心成立以来，为省内外300余名截瘫和偏瘫病人进行了肢体康复治疗，为近百名失语、构音障碍患者进行了语言康复治疗。成为省内唯一一家规范的现代神经康复治疗中心，极大地降低了致残率，受到省内外医学专家的充分肯定和患者及社会各界的好评。2000年，该项目被山东省卫生厅列为省级继续医学教育项目之一。
微创治疗高血压脑出血 是我院神经内科应用微创清除技术治疗高血压脑出血的特色疗法，该法创伤小，有效的降低了高血压脑出血病人的死亡率和致残率，该项目被卫生部列为面向农村和基层医疗单位十年百项技术推广项目，该院被卫生部医药卫生科技发展研究中心和全国脑血管病诊治研究办公室指定为此项技术的全国四个临床指导中心之一。
介入放射治疗中心
介入放射治疗中心 自1990年以来，在省内率先开展动脉导管灌注化疗治疗多种中晚期癌症，应用食管支架置入术治疗各种食管癌性狭窄，先后治疗病人2120余例次，延长了病人的生命，提高了生活质量，使很多病人重新树立了生活的信心。2000年，山东省卫生厅决定由我院与军区总院共同承担本项省级继续医学项目。
心血管病的介入治疗 是我院开展的又一类新技术、新项目。先后开展了心腔造影、冠脉造影、经皮冠脉介入治疗（经皮冠脉球囊扩张成形术和支架置入术）、心律失常的射频消融术、起搏器安置术及肾动脉狭窄等周围血管介入治疗术。减轻了病人痛苦，显著提高了治愈率。
在保持和提高原有特色项目技术优势的同时，全院不断开展新技术、引进新项目，相继开展了周围血管静脉血栓的介入治疗，睡眠呼吸暂停综合症的检测和治疗，体外循环手术，输尿管镜气压弹道碎石治疗泌尿系结石，经尿道前列腺气化电切术。经皮穿刺腰椎间盘切吸术，各种内窥镜技术的推广应用等，使医院的整体技术水平有了很大的提高。为医院的进一步发展打下了良好的基础。
