加长版特别篇
指《名侦探柯南》TV版动画中偶尔播出的长度超过一般剧集（30分钟）的电视特辑，简称SP，一般所称的“特别篇”均指代此类。计入电视动画正式剧集。（动画列表中以“★”进行标示）
《魔术快斗》相关特辑
属于《名侦探柯南》的特别篇动画，以第二代怪盗基德（黑羽快斗）为主要人物，改编自青山刚昌的另一部漫画作品《魔术快斗》。虽在柯南播放时段播出，但官方未将其计入柯南动画正式剧集。后其相应内容以《魔术快斗》正式动画的形式独立发行，并收录于DVD与BD中。
其中《怪盗基德诞生的秘密》是“M 14公开纪念特别篇”，属于剧场版特典，改编自2010年4月17日于ANIMAX频道独立播放的《魔术快斗》动画第1集《复活的怪盗》。其他集数均未以《魔术快斗》动画形式独立播出。
序号
名称
播出时间
对应《魔术快斗》漫画
1
名侦探柯南 M 14公开纪念特别篇 怪盗基德诞生的秘密
2010年4月24日
Vol.1 File.1
2
名侦探柯南 怪盗基德夏日祭 怪盗基德忙碌的约会
2011年8月6日
Vol.1 File.4
3
名侦探柯南 怪盗基德夏日祭 公主殿下爱魔术
2011年8月13日
Vol.1 File.2
4
名侦探柯南 怪盗基德特别篇 魔女不流眼泪
2011年9月24日
Vol.1 File.6 & Vol.2 File.4
5
名侦探柯南 怪盗基德特别篇 命运的蓝色生日
2011年10月29日
Vol.3 File.5
6
名侦探柯南 怪盗基德特别篇 恋爱滑雪场的圣诞夜
2011年12月24日
Vol.2 File.1
7
名侦探柯南 怪盗基德夏日祭 魔术快斗 华丽的对手们
2012年8月4日
Vol.3 File.2-3（有原创剧情）
8
名侦探柯南 怪盗基德夏日祭 红色之泪的秘密
2012年8月11日
Vol.4 File.2
9
名侦探柯南 怪盗基德特别篇 魔女与侦探与怪盗
2012年9月29日
Vol.3 File.4（有原创剧情）
10
魔术快斗 追忆的黄金之眼
2012年11月3日
Vol.4 File.5-6
11
魔术快斗 泪之水晶之母
2012年12月22日
Vol.4 File.1
12
魔术快斗 暗夜骑士爱的眼泪
2012年12月29日
Vol.4 File.7-8
旅游特别篇
自2001年以来，小学馆开始进行“旅游篇”特别策划。大多为每年制作一次，均为动画原创故事，描写主人公到日本一些著名的景点时遇到事件，也介绍了当地的名胜和文化特色。为了配合现实中由JR西日本、JR九州等铁路公司策划的神秘之旅活动而制作。[11]
集数
名称
播出时间
主要景点
236~237
南纪白滨的神秘之旅
2001年6月
白滨温泉、三段壁、白良滨（和歌山县）
255~256
松江玉造连句大战十四回合
2001年10~11月
松江城（岛根县松江市）
299~300
关门海峡的友情与杀机
2002年11月
关门海峡（山口县 福冈县 本州与九州交界处）
342
豪斯登堡的新娘
2003年11月
豪斯登堡（长崎县佐世保市大湾村）
377~378
桃太郎解谜之旅
2004年11月
仓敷市（冈山县）
419~420
八岐大蛇的剑
2005年11月
出云市（岛根县）
518~519
明治维新神秘之旅
2008年12月
美弥郡秋吉台国家公园 - 秋芳洞（山口县）
554~555
鹳的探索之旅
2009年11月
城崎温泉（兵库县）
594~595
广岛宫岛的七大不可思议之旅
2010年11月
广岛、宫岛（广岛县）
640~641
8枚速写记忆之旅
2011年12月
仓敷市（冈山县）
678~679
长崎谜之剧场
2012年12月
长崎市（长崎县）
720~721 火与水的神秘之旅 2013年11~12月 阿苏市（熊本县）
761~762 加贺百万石神秘之旅 2014年12月 金泽市、加贺市（石川县）
801~802 鸟取沙丘神秘之旅 2015年11~12月 仓吉市（鸟取县）
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