自中国科学院上海应用物理研究所成立以来，已取得了显著的科研成果，累计超过600项。其中一项重要成就便是自主研发并成功建造了我国首台1.2米回旋加速器，后经过改造升级为1.4米等时性回旋加速器，这一创新使得我国在新核素合成领域实现了零的突破，例如成功合成并鉴定了新核素Pt-202。
该研究所还开发出世界上第一台超灵敏小型回旋加速器质谱仪，这一技术的突破对于科学研究具有重要意义。此外，他们还研发出我国首个被国家药典收录的放射性药物，为医疗领域提供了新的治疗手段。
在荣誉方面，该所收获了众多科技奖项，共计164项，其中包括5项国家科技进步奖和4项国家自然科学奖，充分证明了其科研实力。例如，“重离子核反应的集体效应、奇异核产生及其性质研究”和“重质量丰中子新核素的合成鉴别和研究”项目荣获了国家自然科学二等奖，这些都是该所科研工作的杰出体现。
中国科学院上海应用物理研究所筹建于1958年10月，1959年8月正式成立，时称中国科学院上海原子核研究所，2003年6月经国家批准定为现名。拥有两大园区，分别坐落于上海市科技卫星城嘉定区和浦东张江高科技园区，占地面积共约700亩。是专业从事民用非动力核技术科学研究的国立研究所，以同步辐射等先进光源技术、束线技术及离子束技术研究，标记化合物与放射性药物、辐照新材料及辐照装置、先进探测与成像技术等民用非动力核技术科学的基础、应用研究及其相关交叉、边缘学科研究为主，同时积极推进民用非动力核技术科学研究成果的产业化。