广东省有全国最多的正厅级海关，都由海关总署直属，分别管辖广东这些地区。
广东目前是全国海关机构和人员最多的省份，共有广州、深圳、拱北、汕头、黄埔、江门、湛江等7个厅级直属海关，下设90多个隶属海关、办事处。
1.广州海关。正厅级，管辖范围为广东省广州市越秀区、海珠区、荔湾区、天河区、白云区、花都区、番禺区、南沙区、从化区，佛山市、肇庆市、韶关市、清远市、云浮市、河源市及深圳市大铲岛的海关管理工作。
2. 深圳海关。正厅级，管辖范围为广东省深圳市、惠州市的各项海关管理工作。
3. 拱北海关。正厅级，关区范围包括珠海、中山两个地级市。
4. 汕头海关。正厅级，关区覆盖包括汕头、梅州、汕尾、潮州、揭阳等5个地级市，普宁1个县级市。
5. 黄埔海关。正厅级，关区范围包括广州市黄埔区、增城区和东莞市。
6. 江门海关。正厅级，关区管辖范围包括江门市、阳江市。
7. 湛江海关。正厅级，管辖范围为广东省湛江市、茂名市的各项海关管理工作。
上述海关中，广州海关的管辖范围最广，覆盖广东省行政区域面积约50%。
此外，广东还设有海关总署广东分署，受海关总署委托，承担监督检查、审计巡视等工作职责，联系单位为长沙、广州、深圳、拱北、汕头、黄埔、江门、湛江、南宁、海口、重庆、成都、贵阳、昆明等14个直属海关。