普通共同诉讼基于数人数诉的相互独立性，原告可以选择数人数诉的独立或者合并，符合民诉法的规定，法院应准许原告撤回对普通共同诉讼部分被告的起诉。主体不适格的被告与原告无法律上的权利义务关系，不符合民诉法规定的起诉要件，法院应准许原告撤回对部分主体不适格被告的起诉。
法律分析
民事诉讼中，法官常遇到原告申请撤回对部分被告的起诉，如何处理?我国民事诉讼法对此没有规定，实践中，法官的具体做法不一：有要求原告从起诉书中划掉该被告，有要求书记员将此情形记入笔录，有在判决书中处理此程序问题。笔者认为以上做法欠妥，法官应对是否准许作出书面或者口头裁定。因为，原告申请撤回对部分被告的起诉，是其对诉权的处分，这属于诉讼中的程序性事项，法院是否准许应用裁定。法院作出书面裁定的，应送达双方当事人，作出口头裁定的，应记入笔录并宣告裁定结果。在确认之诉和变更之诉中，法院应不准许原告撤回对必要共同诉讼部分被告的起诉。因为，确认之诉和变更之诉是原告基于与被告之间的法律关系的存在与否和变更消灭产生的诉求，该法律关系因其必要关联而不可分割，法院应不准许原告撤回对必要共同诉讼部分被告的起诉。
法律依据
《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百四十五条 宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。人民法院裁定不准许撤诉的，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以缺席判决。
第一百四十六条 有下列情形之一的，可以延期开庭审理：（一）必须到庭的当事人和其他诉讼参与人有正当理由没有到庭的；（二）当事人临时提出回避申请的；（三）需要通知新的证人到庭，调取新的证据，重新鉴定、勘验，或者需要补充调查的；（四）其他应当延期的情形。
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