工资超过5000扣税可以根据最新的个人所得税税率表，然后使用工资纳税公式就可以计算得出需缴纳的纳税金额。月薪5000，在没参加社会劳动保险和交存住房公积金的情况下，应缴纳个人所得税385元。计算公式，应纳税所得额=月工资总额- 扣除费用标=5000-1600=3400，应纳税额=应税所得额乘适用税率-速算扣除数=3400乘15%-125=385，所以必须要了解缴纳的五险一金和专项扣除金额的已知数。没有超过5000元则无需缴纳个人所税。
《中华人民共和国个人所得税法》
第三条
个人所得税的税率：
（一）综合所戚祥得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；
（二）经营所得，适高谈搏用侍橡百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。”
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