找CRO做代谢组学检测需要注意哪些关键点？

Question

如题所述

Answer 1

整体。既包含CRO公司品牌、商誉、组织人才、实施案例、客户口碑、公司大小，还包含技术细节、设备实力、人才能力、数据处理能力、服务效率、服务人员是否经验丰富、数据库量和质，此外，还有自己的资金支持、重视程度、目标层次不同等自身需求原因。

全过程。代谢组学又包含样本前处理、数据获取、峰检测、峰对齐、差异特征筛选、化合物鉴定、二级谱验证、定量检测等流程，其中除了实验标准，质量把控要严格外，一直被大家疏忽的还有数据处理部分，如果检测信号不准确，批次效应无法对齐，不同方法得到的实验结果完全是不一样的。下面实验时我用相同数据，采用不同软件得到的PLSDA结果图，可以看到左边图完全分不开，右侧图能够清晰分开，可以看出不同峰检测算法对于信号的检测对比差异非常明显。所以，我们需要把控实验前处理质量和方法的同时，还需要考察CRO公司的数据处理能力。

核心。有无自建的谱图数据库和高精度的智能峰检测算法，对于提高化合物覆盖度、鉴定率、准确性至关重要，不同数据处理方法的结果是天差地别的。

Answer 2

1. 公司整体规模。一定要找专业做代谢组检测的企业，至少要做代谢组起家。很多宣传什么都能做的公司，其实代谢组检测是外包的。
2. 公司的真正检测实力。这就要看真实的检测数据了，可以先送少量样本做下预实验，看看看结果。其实也可以通过这个公司发表的文章数量、合作单位以及影响因子来看他的真正实力。
3. 产品特征。公司要有自建的本地数据库，这对物质定性的准确性至关重要；定量方面，目前业界内公认的黄金定量标准是MRM，可以选择这种技术来开展检测。
我们课题组之前有个大样本量的项目，所以在阿趣，中科，迈维都做了试测，最后选择了迈维。你可以多找两家了解下。