仲实不乐仕进，殚心教育。1901年客游广东信宜县，为起凤书院山长，成《尚书谊略》二十八卷。1902年，清廷诏开学堂，次年先生应山东高等学堂之聘为教习。后被安徽高等学堂监督严复聘为伦理教习，任教六年，编讲义多卷，以授诸生。由先生编定的讲义有《伦理学》 、《诸子考略》、《群经考略》、《群儒考略》、《十三经述要》、《七经问答》、《大学古本解》等。其后皖省各种人才，多出于安徽高等学堂。
1909 年（宣统元年），清学部大臣奏荐仲实为学部咨议官。适逢其长子焕自日本留学，归京就职。京师法政专门学堂监督乔树楠聘先生为国文教习。于是先生挈家入京，教授京师法政学堂，撰成《蜕思轩读经记》 及《外国文学》 两书。1914年，仲实应北京大学聘，任文科教授。清史馆长赵尔巽复聘先生充清史馆纂修，乃成《清史稿》 四十余卷。民国七年，绩溪胡适自美国归，为北京大学教授，倡文学革命之论，评斥林纾，力排桐城派古文。适萧县徐树铮创正志学校，延姚叔节为教务长，于是仲实及林纾咸入是校讲学。先生在北京凡十二年，前后编印有《文学研究法》、《史学研究法》、《史事举要》、《旧闻随笔》等书。先生教授于大学时，危坐诵说，神采照人。诸生受其讲授者，之于课业无不豁然贯通，造就成材者不可胜数。
1921年，先生南归。旋职掌秋浦周氏宏毅学舍教务三载。其间，曾为桐城中学第十四届学生讲课。据其弟子姚沛生云：“先生是时，目已失明，由校工扶至课堂。先生凭记忆，边诵边讲，纵横裨阖，剖析人微，不仅课中正文无一字讹误，文中各家注解，也娴熟如数家珍。听课学生无不钦佩之至。”1926年秋，赴南京，教授东南大学。其时编有《蜕私轩易说》、《诗说》、《论语解注合编》、《古今体诗约选》 、《惜抱轩诗训纂》 等书。1928年初，皖省筹建安徽大学，本年秋开学，聘先生为教授，与开县李大防、长沙陈朝爵、同里播田，共事于文学院，均为有名教授。而先生尤为耆宿，高闻雅望，远近无不倾慕。复与李大防、陈朝爵应秋浦周氏之请，编纂《历代圣哲学粹》 刊印于世。先生执教安徽大学九年，1936年秋谢病归里，年已七十有六。1937年夏，抗日战争爆发，次年倭寇侵掠皖境，先生乃挈家小避宿松。未几，由赣人湘，止于桂林。1939年7月卒，享年七十有九。
