亲子鉴定一般单指特定的几个稳定基因的对比，，所以血缘关系越近的相似度越高，尤其双胞胎兄弟的根本无法区分，，具体见下面介绍。
DNA鉴定
鉴定亲子关系目前用得最多的是DNA分型鉴定。人的血液、毛发、唾液、口腔细胞及骨头等都可以用于亲子鉴定，十分方便。
一个人有23对（46条）染色体，同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。如果检测到某个DNA位点的等位基因，一个与母亲相同，另一个就应与父亲相同，否则就存在疑问了。
利用DNA进行亲子鉴定，只要作十几至几十个DNA位点作检测，如果全部一样，就可以确定亲子关系，如果有3个以上的位点不同，则可排除亲子关系，有一两个位点不同，则应考虑基因突变的可能，加做一些位点的检测进行辨别。DNA亲子鉴定，否定亲子关系的准确率几近100%，肯定亲子关系的准确率可达到99.99%。
DNA亲子鉴定主要通过以下特征来判定
体细胞稳定性：同一个体的血液、唾液、精液以及各器官组织DNA是一致的，并且对同一健康人来说是终生不变的，这是最基本的前提。
个体高度特异性：不同个体DNA 分子水平上遗传本质的差异，决定了同一种限制酶消化基因组DNA ，某一个体与另一个体的等位基因片段在数量和长度上是不可能相同的，从而产生具有个体特异性的DNA 。
按孟德尔遗传规律遗传：通过大量的家系调查证明，子代DNA 中所有等位基因带都可以在双亲的DNA中找到，片段的传递符合孟德尔遗传规律。
常见的问题
1. 什么是DNA亲子鉴定测试?
DNA（脱氧核糖核酸）是人身体内细胞的原子物质. 每个原子有46个染色体，另外,男性的精子细胞和女性的卵子，各有23个染色体，当精子和卵子结合的时候.这46个原子染色体就制造一个生命，因此，每人从生父处继承一半的分子物质，而另一半则从生母处获得。
DNA亲子鉴定测试与传统的血液测试有很大的不同. 它可以在不同的样本上进行测试，包括血液，腮腔细胞，组织细胞样本和精液样本. 由于血液型号，例如A型，B型，O型或RH型，在人口中比较普遍，用于分辨每一个人，便不如DNA亲子鉴定测试有效. 除了真正双胞胎外，每人的DNA是独一无二的. 由于它是这样独特，就好像指纹一样，用于亲子鉴定，DNA是最为有效的方法.
2. DNA亲子鉴定有多准确?
DNA亲子鉴定是目前亲子测试中最准确的一种. 如果小孩和测试男子的DNA模式在一个或多个的DNA探针上不吻合，那么被测试男子便被100%排除，即他是0%可能是亲生父亲. 他不可能是孩子的生父.
如果是母亲，孩子和被测试父亲的DNA模式完全吻合，那么可以计算出99.97%或更大的或然率.，这个结果证明他是实则完全证实小孩的亲生父亲.大部分的美国法庭接受90%或然率作为生父证明的证据.
3. 孩子要到某一年龄才可接受DNA亲子鉴定测试吗?
DNA亲子鉴定测试是无年龄限制. 传统的血型测试 要小孩至少6个月. 还有，要大量的血液样本，通常是要两大茶匙以上. 这种方法应用于小孩身上较困难。相反，DNA亲子鉴定只是 要很少几滴的血液(约1/4 或 1/2 茶匙)，或是口腔抹擦所得的腮细胞，这种用少量的血液或口腔测试，使DNA测试甚至可以在新生婴或小孩身上进行。由于DNA是形成于结合期，测试甚至可以在小孩末出世之前，使用（Chorionic villi Sampling/CVS) 胎盘素或抽羊水(amniocentesis) 方法来进行.
亲子鉴定可以在已逝世的人的由殡仪馆工人收集的样本上进行. 当一个人已辞世或失踪，还可以在其有血缘关系的亲属上重新编排他或她的DNA组织。