有核养殖珍珠与天然珍珠在内部结构和珍珠层结构上有显著差异。区分它们主要依据结构上的这些差异。淡水无核养殖珍珠与天然珍珠也在许多方面存在差异。以下是天然珍珠与养殖珍珠的鉴别方法：
1. 肉眼及放大观察：天然珍珠质地细腻，结构均一，珍珠层厚，光泽强，通常呈半透明状，外形不规则，直径较小。而有核养殖珍珠通常形状规则，呈圆形或椭圆形，水滴形等，珍珠层较薄，光泽不如天然珍珠强，表面常有凹坑，质地松散。
2. 强光照明法：天然珍珠看不到珠核与核层，无条纹效应；有核养殖珍珠可以看到珠核和核条带，大多数呈现条纹效应。
3. X射线照相法：天然珍珠的X射线照片上出现假六方对称图案的斑点；有核养殖珍珠出现假四方对称图案的斑点，仅一个方向出现假六方对称斑点。
4. 紫外线摄影法：天然珍珠在紫外线照射下的阴影颜色较均匀一致；有核养殖珍珠在核层与光线垂直情况下，产生深色阴影，仅周边颜色较浅。
5. 荧光法：天然珍珠在X射线下大多数不发荧光；养殖珍珠在X射线下多数发荧光和磷光（蓝紫色、浅绿色等）。
6. 内窥镜法：通过内窥镜可以看到，养殖珍珠光反射到内壁后沿核内平行层传播，一直能穿透薄的珍珠层，使得在显微镜一端看不见光线；而天然珍珠光射到内壁后，因全反射而绕珍珠层内传播，最后投射到第二个镜面上，在另一端的显微镜上便能观察到光线的闪烁。
7. 磁场法：圆形珍珠放在磁场内，养殖珍珠的珠核受磁化后，总要转到平行层走向与磁力线平行的方向，而天然珍珠无核，故无此现象。
8. 重液法：一般养殖珍珠因有珠核，比重较大，天然珍珠较轻，因此，往往在2.71的重液中天然珍珠大都上浮，而养殖珍珠普遍下沉。这种方法可能会损伤珍珠层，应谨慎使用。
处理珍珠包括珍珠改善和改色两部分内容。珍珠的改善方法主要包括漂白、增色、增光、改色、抛光等，而珍珠的改色方法有染色、辐照等，通常把珍珠染成黑色或用各种射线将珍珠辐照成黑色来仿黑珍珠。除此之外，市场上还有改色而成的红色、绿色、蓝色、金色等珍珠。由于珍珠改善一般是必要的过程，因此，以下主要对改色珍珠的鉴别方法作简要说明。
1. 用肉眼观察：在串珠中，如每粒珍珠颜色都一样，一般是染色的特征；而天然色在外观上很柔和，并有伴色，所以每粒珠的颜色虽一致，但还有区别。天然黑珍珠其实不是纯黑色，带有兰或紫色的伴色。
2. 用放大镜观察：染色珍珠在钻孔中能见到染色剂的堆积，有时可见绳子上也被染色。
3. 紫外线照射法：人工养殖的黑珍珠的珍珠层一般不发荧光，但在紫外线的照射下，在小凹陷中仍能发出淡黄色或白色的荧光，而在长波紫外线下发出粉红色或红色的荧光。而染色黑珍珠在任何情况下不发荧光。
4. 粉末法：染色黑珍珠的粉末为黑色，而自然黑珍珠其粉末为白色。此法对珍珠有破坏作用，不能随意使用。
除上述常规方法外，还可以利用红外光谱、拉曼光谱、X射线粉晶衍射及扫描电镜等先进的测试技术来鉴别不同类型、不同成因的珍珠，如海水养殖珍珠和淡水养殖珍珠、天然珍珠与染色珍珠、天然珍珠与辐射处理珍珠等。
仿制珍珠是一类由人工制作的用来仿冒珍珠的材料，根据材料特性和制作方法可分为下列几种：
1. 塑料珠：是由塑料制成的珠子，外面涂有珍珠颜料，看起来很漂亮，其特点是手感很轻。
2. 玻璃珠：早在17世纪，玻璃已被用来模仿珍珠，一位法国玫瑰厂家的祖坤（Joquin）发现洗过鱼的水留下一种闪光的物质，使用这些物质浓缩制成珍珠颜料。1656年祖坤便开始仿制珍珠，他是用空心的玻璃珠子浸入酸性气体中，将玻璃的光泽除去，然后用他发明的珍珠颜料涂在珠子内部，再放入蜡或胶使珠子重量增加，这类仿制品在古老的首饰品中常出现。
3. 实心玻璃珠：也称马约里卡珠（Majorca）。是西班牙人发明的仿珍珠，由于工序精细，可以假乱真，享誉各国。马约里卡珠是由乳白色的玻璃制成核，然后在表面涂上一种特殊的用鱼鳞制成的闪光薄膜。优质的仿制珠，要涂上30多层，每层需在不同的时间涂上，这样可产生光的干涉和衍射，使表面形成灿烂的色彩，在珠核覆膜过程中，要进行几道浸液的烘干、清洗和抛光的工序，最后一步是使用一种特殊的化学浸液，可能是醋酸纤维素和硝酸纤维素来聚合有机物质，使表面硬化，以免产品受损，这种仿制珠，其外形与海水养殖珠极相似，常被镶嵌于现代款式的K金首饰上，产品畅销全球。
4. 贝壳珠：用贝壳磨成珠子，然后在珠子表面涂上珍珠颜料，制成贝壳珠。
真假鉴别和质量评价
珍珠的鉴别主要包括：真珍珠与仿珍珠的鉴别、天然珍珠与养殖珍珠的鉴别、有核养珠和无核养珠的鉴别、未处理珠与处理珠的鉴别等课题。以下作简要介绍。
1. 真珍珠与仿珍珠的鉴别
(1) 直观法：是最简便易行的方法，直接用肉眼观察，如果是串珠，其颜色、形状、大小、光泽都一致的话，极有可能是仿珍珠。由于真珍珠是从不同的动物个体中取出的，绝不可能完全一致。
(2) 感觉法：通过手或舌的感觉，真珍珠有凉感，仿珍珠则无；用手或牙轻磨，感觉光滑者是仿珍珠，有粗糙感的为真珍珠；用手掂，仿珍珠的塑料制品很轻，玻璃制品较重。
(3) 放大镜观察法：用10倍放大镜仔细观察真珍珠表面能见到生长纹理，仿珍珠表面光滑，在珍珠的钻孔处明显粗糙，或常见到薄层剥落的现象，这是仿珍珠，真珍珠很少有这种现象。
(4) 弹跳法：从60厘米高处掉在玻璃板上，真珍珠弹跳高度为20-25cm，而仿珍珠在15cm以下。这种方法可能会对珍珠产生损伤，应该谨慎使用。
(5) 盐酸反应法：用稀盐酸少许滴在表面，真珍珠立即起泡，而仿珍珠无反应。此方法对珍珠表面有损害作用，谨防使用。
(6) 紫外线荧光法：真珍珠在紫外线下产生淡黄或淡白的荧光，这是由于珍珠层中含有蛋白质所致，而仿珍珠不产生荧光。
(7) 物理性质测试：真珍珠与仿珍珠的物理性质（如折射率、密度等）存在较大差别，通过测试物理性质，较易将它们区分开来。
珍珠分为海珠和淡水珠，有天然的和人工的之分。有些珍珠还有有核的和无核的区别。在人工珍珠中，一类产自人工饲养的珍珠贝，另一类是用质次珍珠研磨成粉，再制作成不同的珍珠，后者在价值上不仅与前者有很大差别，与天然珍珠更不在同一档次，因此在选购珍珠时尤应注意。
珍珠的光泽是美丽耀眼的，这种效果是由光线从珍珠表面进入珍珠层底面后反射出来的。在所有珍珠中，大珠母贝和合浦珠母贝所产珍珠的光泽是贝类中最强的，因此最引人喜爱，这些珍珠晶莹夺目，就像天中满月的月光一样柔和，其效果是其他贝类难以比拟的。
珍珠的颜色五光十色，淡水珠常见的有金黄色、紫色、粉红色、蓝色和奶油色等。海洋珍珠的颜色较少，一般有银白色、金黄色、蓝色和黑色等。
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