中医助理医师及中医执业助理医师的考试内容涵盖了多个专业领域，以确保考生全面掌握中医和中西医结合的知识。首先，中医基础科目包括:
中医基础理论：着重于研究中医经典著作的内容，要求考生深入理解中医独特的理论体系。
中医诊断学：涉及疾病的辨证论治和诊断方法，是临床实践的基础。
中药学：涵盖了中药的种类、性质、功效以及配伍应用等。
方剂学：研究如何根据中医理论配方剂，治疗各种疾病。
在中医临床医学科目上，考试内容涵盖:
中医内科学：探讨人体内部器官疾病的诊断和治疗。
中医外科学：涉及皮肤、外科手术和创伤的中医治疗方法。
中医妇科学：关注女性健康，包括妇科疾病的诊断与治疗。
中医儿科学：专门针对儿童疾病的诊断和防治。
针灸学：中医特色疗法之一，通过刺激特定穴位来调节人体机能。
值得注意的是，自2010年起，考试取消了针对中医（含民族医）中师承和确有专长人员的西医内容，以突出中医特色。同时，考试中增加了壮医、朝医和傣医的考试科目，壮医从2010年起每年举行一次，而朝医和傣医则从2011年起每两年进行一次，以推广和保护少数民族医药知识。