三脉七轮说的发展经历了五个阶段：
第一阶段是在释迦摩尼之前，就有比较原始的印度气脉学说，也有关于三脉以及各脉轮的学说，在婆罗门教内传习
第二阶段是
佛教建立以后，
释迦佛也开示过部分关于气脉的修习方法，但由于是应机而说，也没有整理和集结，所以并不完整，是佛教化的三脉七轮说的雏形，这种修法在极小范围内流传
第三个阶段是
阿难再铁围山集结大乘经典以后，系统的完整的密宗修法逐渐开始传出，出现了正统的佛教化的三脉七轮说
第四个阶段是婆罗门教在与佛教的相处中，相互吸收对方理论，婆罗门教发展为
印度教并演化出了比较成熟的具有印度教特色的三脉七轮说
第五个阶段是近现代，一些印度教的宗教领袖提出讲
瑜伽修习去宗教化，让非印度教者也能体会到瑜伽的乐趣，无宗教的三脉七轮说开始在各国流行。
值得一提的是印度教的三脉七轮和佛教的三脉七轮，无论是在事相上，还是其本质，都是有很大区别的。其中，佛教的三脉七轮说起源于释迦摩尼，集结于阿难，在集结中演化为系统的成熟的三脉七轮说。