行政部门和机构总统和副总统领导的行政分支设有15个部和多个专门机构，它们构成日常所说的"政府部门"。这些部门负责贯彻执行法律，提供各种政府服务。政府的作用具有深远影响，也关系着所有美国人的生活。这15个部门是：- 农业部 (Department of Agriculture) - 商务部 (Department of Commerce) - 国防部 (Department of Defense) - 教育部 (Department of Education) - 能源部 (Department of Energy) - 卫生与公众服务部 (Department of Health and Human Services) - 国土安全部 (Department of Homeland Security) - 住房与城市发展部 (Department of Housing and Urban Development) - 内政部 (Department of the Interior) - 司法部 (Department of Justice) - 劳工部 (Department of Labor) - 国务院 (Department of State) - 运输部 (Department of Transportation) - 财政部 (Department of the Treasury) - 退伍军人事务部 (Department of Veterans Affairs) 上述各部部长由总统任命，并经参议院批准。根据法律，部长为总统内阁成员，是总统在相关领域的顾问。总统也可以让某些高级行政官员享有内阁地位，其中通常包括副总统、总统办公厅主任(the President's Chief of Staff)、管理及预算办公室主任(director of the Office of Management and Budget)、美国贸易代表(U.S. Trade Representative)。其他目前或曾经具有内阁地位的职务包括：环境保护署署长(director of the Environmental Protection Agency)、中央情报局局长(director of Central Intelligence Agency)、以及总统国家安全顾问(President's national security advisor)。除总统内阁以外，行政分支中设有很多独立的机构和委员会，其中有些颇具规模。例如，美国邮政管理局(U.S. Postal Service)、环境保护署、国家航空和航天局(National Aeronautics and Space Administration)等。权力很大的一类行政机构是联邦管理机构。这些机构由国会授权，负责制定和执行管理某一经济领域的规章，通常涉及复杂的技术环节。主要的联邦管理机构有：- 证券交易委员会 (Securities and Exchange Commission) - 联邦贸易委员会 (Federal Trade Commission) - 核管理委员会 (Nuclear Regulatory Commission) - 食品和药物管理局 (Food and Drug Administration，属卫生与公众服务部) - 联邦电讯委员会 (Federal Communications Commission) - 环境保护署 (Environmental Protection Agency) - 平等就业机会委员会 (Equal Employment Opportunity Commission) - 职业安全与健康管理局(Occupational Safety and Health Administration，属劳工部) (OSHA). 由上述机构和其他相关管理机构确立的规章制度关系到全国几乎各行各业和所有的消费者。这些管理委员会或局署的负责人也由总统任命和经参议院批准。这些机构制定的规章具有法律效力，但可以在法庭上受到挑战或被国会推翻。在所有独立的联邦机构中，独立性最大的机构莫过于联邦储蓄系统(Federal Reserve System)，也就是国家中央银行(简称美联储)。联邦储蓄系统管理委员会负责制定国家货币政策、确定利率以及货币供应量。美联储的决定能够对国家经济、利率、通货膨胀、就业机会以及国际贸易产生深远影响。很多人甚至认为，美联储主席是仅次于总统的联邦政府中的第二大权力人物。
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