一、指代不同
1、二类本科：是指本科二批录取。
2、三类本科：即第三批本科，是指中国高考本科层次录取批次和录取顺序排在第三位置，又称“本科三批”、“三本”等。
二、特点不同
1、二类本科：普通二本为仅次于提前批本科和一本（最高位次）而言，每年普通二本线由考生总成绩而有所不同。
2、三类本科：就是一些依托一类，二类院校建立起来的院校，多是私人开办，师资多是从一类院校高薪聘请的老师或者从社会上招募的老师，依托一些名校，依靠名校的名望进行招生。
三、发展不同
1、二类本科：许多普通二本大学无论学生素质还是师资力量都接近一本大学。而且许多普通二本大学因为特色明显、地理位置优越，甚至录取分数还超过当地的一本。
2、三类本科：根据参加全国统一高考录取的方式进行的。 三本与一、二本都是属于“普通高等学校”教育系列，学制为四年，毕业证书和学位证书都是相同的“普通高等学校”教育证书。
参考资料来源：百度百科-三类院校
参考资料来源：百度百科-二本
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