因为降脂药物在肝脏代谢，因而可加重肝脏的损害。因此，活动性肝炎的病人不适合服用降胆固醇的药物。
动脉粥样硬化是一个相当缓慢的过程，某一时期内停止服用降脂药物对治疗原发性高胆固醇血症的远期效果的负面影响是微乎其微的。再加上胆固醇及其生物合成途径的其他产物是胎儿发育不可缺少的成分，包括类固醇和细胞膜的合成。值得注意的是，他汀类降脂药物在降低胆固醇生物合成的同时，就已经减少了胆固醇生物合成通路的其他产物，孕妇服用这类降低血脂药物很可能损伤胎儿。因此，怀孕或哺乳期妇女不宜服用降胆固醇药物，暂停服用，利远远大于弊。
由于许多药物经人乳分泌，而且降脂药物潜在的副作用，从这一角度来说，哺乳期妇女也不适合服用降脂药物。
所以，并非所有的冠心病病人都适合进行降低胆固醇的治疗。老年病人，慢性充血性心力衰竭、痴呆、晚期脑血管疾病或活动性恶性肿瘤的病人，采取降脂治疗是有很大弊端的。
我国有较多的学者认为，胆固醇“低比高好”，但不赞同“越低越好”。医学调研资料显示，中国人脑出血发病率较西方国家高，应该清楚脑出血发病率随血清胆固醇水平下降而降低，一旦血清胆固醇水平小于3.64毫摩尔／升(140毫克／分升)时，脑出血者非但不降低反而会增多。有的研究也表示，中国人血清胆固醇水平小于3.64毫摩尔／升者寿命较短。
对于老年人来说，最佳胆固醇范围在5.2～5.6毫摩尔／升(200～219毫克／分升)之间。低胆固醇并非老年人健康的必须因素之一，极低胆固醇可能与冠心病有关，这说明高龄病人的降脂治疗要多加小心，降到适当水平即可。