占用农田建房能匿名投诉，可以通过以下途径进行举报：
1、向当地自然资源主管部门举报：您可以直接向当地的自然资源局或者土地管理部门进行举报。这些部门负责土地的管理和监督，有权对违法行为进行调查和处理。
2、通过12345政府服务热线举报：在中国，12345是政府服务热线，可以通过拨打这个电话进行匿名举报。
3、在线举报：许多地方政府和部门提供了在线举报平台，可以在这些平台上填写举报信息。这些平台通常会保证举报人的匿名性。
4、向纪检监察部门举报：如果涉及到公职人员违法违纪行为，还可以向当地的纪检监察部门进行举报。
5、通过社交媒体或新闻媒体曝光：在某些情况下，通过社交媒体或新闻媒体公开曝光违法行为，可以引起公众和有关部门的关注，促使问题得到解决。
非法占用基本农田的处罚标准：
1、违反土地管理法规，非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。单位犯本罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照本条的规定处罚。
2、占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的，或者因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令限期改正或者治理，可以并处罚款，构成犯罪的，依法追究刑事责任。
综上所述，虽然举报途径通常允许匿名，但在实际操作中，确保个人信息的安全和隐私保护仍然非常重要。在进行举报时，应避免透露可能识别身份的信息。
【法律依据】：
《土地管理法》
第三十四条
乡（镇）人民政府应当将永久基本农田的位置、范围向社会公告，并设立保护标志。公众可以通过公告和保护标志了解具体地块是不是永久基本农田。
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