《红楼梦》作为四大名著之一，是名副其实的畅销书。既然爱好者众多，各出版单位纷纷出版，市面上版本众多。又因为出版者所用的底本不同，红楼梦新出的版本也是各式各样。看了以下，你所看的版本，应是近年来新版的，它与以前版本的不同，就是搜积了很多不同版本的评语，放在正文之前，我觉得，这种做法很没意义。因为，一般的读者，对这些评语未必感兴趣，大家更关注的是正文。而对于研究者来说，把各个版本不同的评论放在一起，也没必要。因为不同的版本，有不同的评论，不同的评论也各有其原因，这原本也是红学研究的问题，混放在一起，反而弄的混乱了。题主问的这些小方格不是正文内容，而是脂批中缺失的内容。
《红楼梦》一书，最初名《石头记》，是以手抄本的形式流传于世的。
作者写完书稿，有一助手帮助其誊抄清楚，这个助手就是脂砚斋。
脂砚斋在抄写的同时，也根据自己的读书心得，或作者的创作背景、创作初衷，作朱笔点评。脂批中对作者的创作意图和隐喻进行说明，为红学的"探佚学"分支提供了最直接、最主要的依据。
流传于世的经脂砚斋点评的《石头记》钞本，书名为《脂砚斋重评石头记》。根据点评的干支纪年被称作甲戌本、庚辰本、己卯本等，后人又把带脂砚斋批语的钞本抄写流传。在反反复复抄写过程中，原来的批语就出现了漏字、讹字。
现在有人把甲戌本、庚辰本、己卯本等各种抄本的批语整理在一起出版。这些评语有的写在小说的回前，有的写在小说的回末，有的写在书页的一侧，被称为回前批、回后批、眉批、侧批等。
题主展示的这个图片中的书，就是带脂批的版本。这是第十三回的回前批。批语在传抄过程中有漏掉的字，出版时就用小方格代表了漏的字。每一个小方格代表一个字。钞本这一回缺了半页，因而缺失的字很多，所以出现了很多小方格。
第十二回和第十三回，写到了秦可卿之死。
根据畸笏叟批语可知，这部分内容改动很大，删去了五六页的内容，作者把秦可卿真正的死因做了改动。此回批语较多，从这些批语中，我们可以窥见秦可卿是在天香楼自缢而亡。