防治鼠害应坚持预防为主的原则。一旦发生，常常是毁灭性的危害，尤其是各种鼠害来势凶猛，往往在很短时间内造成无法挽救的损失，而且一般较害虫的防治困难。所以做好鼠情调查十分重要。调查鼠情发生密度及种类两方面的内容，以便针对不同鼠种的特性和食性采取相应的防治方法。同时，还要注意菇棚、菇畦周围草场上的鼠害分布状况，以及半人工栽培草场临近山坡、牧场、荒地上鼠害发生的情况，以防范害鼠的迁入与危害。具体防治措施如下：
1.清理环境 创造良好的生态环境，预防害鼠迁入。建造菇棚或菇畦，应远离居民区、仓库、暗水沟及树林等易潜藏害鼠的场地，建棚后彻底清理菇棚附近的石堆、草垛等。旧棚应在进料前堵除鼠洞，提前防治。
2.毒饵诱杀 这是常用的有效措施。常用毒杀鼠类的药剂如下：
（1）安妥 化学名称为1-萘基硫脲，也称α-萘基硫脲。分子式：C11H10N2S。白色晶体，工业品为灰色或灰褐色粉末，几乎不溶于水，在阳光和空气中稳定。对鼠类毒性大，能引起肺水肿而死亡，对挪威大鼠的致毒剂量为6～8毫克/千克。在灰树花生产上，常制成毒饵诱杀。使用时要注意畜、禽安全。
（2）大隆 化学名称：3-（3-对溴联苯基）-1，2，3，4-四氢萘基-4羟基香豆素。为黄白色结晶粉末，熔点228～232℃，不溶于水和石油醚，溶于有机溶剂。急性毒力很强，对鼠类具有选择性毒力，对其他动物安全。剂型：0.0025%～0.005%的毒饵。一般用0.005%的毒饵，一次投毒，对多种野鼠都有很好的效果。
选用鼠类最喜食的诱饵，拌入适量的杀鼠药进行诱杀。如大家鼠宜用饭食、蔬菜及肉类做诱饵；沙土鼠选用麦类；莫氏田鼠选用胡萝卜、马铃薯、蔬菜为宜；鼢鼠选用大葱、胡萝卜效果最佳。其次是根据不同杀鼠药和鼠种的体型大小确定有效的用药量。目前市场上出售的杀鼠农药种类很多，据体型中等的鼠种为例，不同杀鼠农药的用量如表6-1。
表6-1 常用杀鼠毒饵的用药量（%）
对体型小的莫氏田鼠，可适当减少用药量，在毒饵中加3%的磷化锌即可；对体型大的鼢鼠则需要10%的磷化锌。拌饵的方法是在鼠种喜吃的粮食中加入一定量的黏着剂如稀面糊、米汤等，拌均匀后再将鼠药拌入即可。也可将粮食煮半熟，捞出后趁热拌入鼠药。用多汁性蔬菜，如大葱、胡萝卜、马铃薯做饵料，均采用生拌法，将饵料切成豆粒大小的块状后拌入农药即可。
使用毒饵诱杀鼠害，必须利用鼠类取食困难的时期，否则因会因鼠食饵少影响毒杀效果。在野外施用饵料选在早春，此时作物尚未播种，牧草也未发芽，诱饵毒鼠的效果最佳。把10～20克饵料投放在鼠类活动觅食的地方或距鼠洞1～2米之内，切忌把饵料投放在鼠洞口或洞内，避免引起鼠类的警觉而拒食。投饵应一次投足，因鼠类一次中毒未死，则不再食饵。对常年生活于地下的鼢鼠，须用辅助工具把饵料投入洞内，方可达到诱杀效果。
投饵扦由扦杆、扦把、旋转式扦筒三部分组成。扦杆铁制，长1.5米左右，并刻有尺度，借此掌握扦杆的深度。旋转式扦筒由铁制的内、外套组成，套筒上有可以旋转开闭的投饵孔，内筒固定在扦插杆上，外筒套在内筒的外面。使用时，把毒饵装入扦筒内，插入鼠洞，旋转把手，使内、外筒的投饵孔重合，让饵料流入洞内。由于鼢鼠怕光、怕风，为防止其堵洞时把饵料推出洞外，拔出扦筒后立刻用湿土堵严扦插孔。
投饵管采用直径3厘米左右的竹管，铲除内节，一端削成舌状，内套一根与竹管内径相吻合可以抽动的木棍。使用时，把木棍插入竹管内，一起插入鼠洞，再抽出木棍，把饵料顺着竹管流入鼠洞内，最后拔出竹管，并用湿土把插孔堵死。
施用毒饵诱杀害鼠，一定要严防人畜中毒。在野外使用毒饵后，严禁放牧鸡鸭和牲畜。室内、外或菇棚内施用毒饵后，要做后标记，严禁玩童入内造成中毒。
3.烟炮熏杀 因鼠类食料充足而撒施毒饵诱杀效果不佳时，可采用烟炮熏杀。先用2～3层废报纸卷成长10厘米、直径2.5厘米的纸筒，一头折死，装入烟炮药料10～15克，在开口的一端加引火捻和少许火药后再把口折死备用。
配制烟炮药是以火药做燃烧剂，加入干马粪末、硫磺和具有熏蒸作用的粉剂型农药。常用的配方如下：
硫磺粉1.5份，火药5份，干马粪末3.5份。
硫磺粉、杀虫药各1份，干马粪末3份，火药5份。
火硝2.5份，杀虫农药2份，干马粪末5.5份。
使用方法是首先查清鼠洞及其相通的洞口，放炮前除留下一个洞口放烟雾炮外，必须把其他洞口全部用土封严堵死。否则鼠类有可能从其他洞口窜逃。如果洞型较大，可多放1～2只烟雾炮，以确保鼠洞内有足够的烟雾毒气，提高杀鼠效果。
4.磷化铝熏杀 在毒饵诱杀或烟炮熏杀困难的情况下，可采用磷化铝熏杀。磷化铝是一种灰绿色片剂，每片3克，在潮湿空气中很快分解放出磷化氢毒气，遇酸反应更强烈。用药方法像烟雾炮一样，摸清洞情并堵好洞口，将磷化铝片剂送入洞内，随后灌水并堵好洞口熏杀。
5.人工捕捉 是人们常用且安全有效的方法之一，如采用鼠夹、地箭、鼠笼、灌水等。防治鼢鼠采用步踩法，根据鼢鼠活动的特点，在有新土堆处，先把洞挖开，并插一草棍，在距离被挖开洞口的20～25厘米处划一踩痕，同时将土铲薄，距离洞穴5～10厘米。因鼢鼠怕光怕风，会很快推土堵被挖开的洞口，并触动草棍幌动，此时立刻对准踩痕重脚猛踏，堵死鼢鼠后退洞道，用铁锨挖出消灭。