自考毕业个人档案是不能放在自己手中的。考生毕业后可以将档案送到所任职企业的人事部，相关工作人员则会帮你放入你个人档案中。暂未就业的自考生毕业后可以选择将自己的档案放到所在地区的街道办事处、当地派出所或者是当地人才交流中心，与自己的人事档案放在一起。
想要通过自考学历报名研究生的，也需要注意。在院校录取本校研究生的时候，不允许考生自持自学考试档案。录取时，招生院校会自行提调你的档案，考生不可自己把档案提交至学校，避免不必要的麻烦。
企业有人事档案管理权，可以独立管理人事档案。毕业生只要将企业详细的档案接收地址提供给学校，学校就可直接转递档案。如果企业没有人事档案管理权，可以选择集体委托存档。将企业委托的人力资源公共服务机构名称提供给学校即可。办理个人委托存档。企业既没有人事档案管理权，又不能集体委托存档，档案将会转递到户籍所在地的人力资源公共服务机构，毕业生可以前去办理个人委托存档。
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