在距离东京南部250公里的海面上，有一个黑潮岛，赛文奥特曼正和来自宇宙的一对 孪生怪兽搏斗着。赛文肩负保卫地球的使命，独自来到地球。玛格玛星人利用这对孪生怪兽攻击赛文。赛文以一敌三，在战斗中，右腿被孪生怪兽折断。正在赛文陷 入困境的时候，一位红色的巨人出现了，那是我们的英雄雷欧奥特曼！雷欧奥特曼与玛格玛星人展开了激烈的搏斗，而赛文奥特曼，却被孪生怪兽围攻，处境十分危 险。玛格玛星人击倒了赛文，向孪生怪兽发出信号，暂时撤退了。
赛文奥特曼变身回团，重伤的他躺在地上。雷欧奥特曼也化身为一个年轻人的模样，奔向他。
“快起来，你怎么了，要坚持住！”年轻人对他喊道。
“你是知道我是团才来救我的吗？”
“我甚至知道，你是赛文奥特曼，也是MAC队的队长。”
“你究竟是谁？”
“我是雷欧奥特曼。”
“雷欧奥特曼？”
年轻人手指天空，说：“我的家就在狮子星座上。在狮子星座上，有一个L77星云，就像地球一样，有着美丽的大自然。但是，L77星云被玛格玛星人和孪生 怪兽毁了。我的父母亲，还有兄弟，他们……从那时候起，我决心生活在地球上，这里就像我的故乡。地球就像我的第二故乡，我改名为凤源，安静的生活着。但玛 格玛星人又来了！”
“凤源，用你的双手，捍卫你所爱的地球。”
“用我的双手捍卫地球？”
“参加宇宙侦察队吧。”
“但是队长，那儿不是有你吗？”
“MAC队需要你，你也需要MAC队！”
“难道有赛文的力量还不够吗？”
团想到了打斗中被孪生怪兽断腿的情景，说：“赛文不存在了，没有赛文了。”说着，他毁掉了变身器。团指着天边的夕阳说：“如果今天渐渐西沉的夕阳是我，那你雷欧奥特曼就是明天早晨的太阳！”
最后，凤源终于同意加入MAC队了。就这样，两位宇宙英雄决定联手为捍卫地球的安全而战。
MAC队的任务，就是保卫地球，防止来自宇宙的侵略，也确保宇宙飞船，在太空中飞行的安全。在指挥室里，队长向大家介绍了新队员，凤源。
凤源原本服务于体育俱乐部。这天，那一对被雷欧奥特曼驱逐的孪生怪兽，带着一个可怕的计划，再次向黑潮岛迫近了。凤源被通知马上到本部报道。本部接到了发来的SOS，距离东京150公里，正在向东京靠近。
“是玛格玛星人！”凤源毫不犹豫脱口而出。但是，他的判断却遭到了老队员的反驳。团命令MAC队出发，凤源也一起参加。在飞机上，风源利用自己的双眼透 视到玛格玛星人的位置所在，认为他可能躲在山谷里。但是，仪器并没有显示出结果，岛上一切正常，MAC返回基地。
回到基地，凤源再一次向团队长肯定，是玛格玛星人干的。
“也许是这样，但是雷达没有显示。”团只是简单的这样说。
“我亲眼看见，它们的目标是东京！东京肯定会遭到怪兽的袭击而下沉的！队长，你们干吗不相信我呢？”
“凤源，不是我不相信你，我们都是宇宙人，因此，有件事别忘了，我们都应该像普通人那样，去看待所有的问题。”
“你曾告诉我，要用双手去捍卫地球，就别管那些了！”
“不对！生活在地球上，就该像人那样去思考！”
“这样做，东京就会遭到毁灭，你没有家人被毁的感受！”
“凤源，地球也是我的故乡。”
“混蛋！东京马上毁了，我们没时间了。”说着，凤源就要出发。
“住手！”团队长拦住了他“你一个人，是对付不了怪兽的！”
“队长，我一定会赢的！”
“凤源！”团队长用拐杖挡在了凤源身前。
这时，传来东京湾洪水泛滥的消息。在东京湾，洪水涌进了房屋，沿岸的建筑全部被冲垮，孪生怪兽登陆东京，人群四处逃窜。凤源冲向前去，手上的戒指闪光， 他口中大喊一声“雷欧”！雷欧出现了！可是，他刚一出现，就被孪生怪兽夹在了中间，高速旋转过后，雷欧倒在了地上。
团队长看到雷欧被击倒，十分担心：不好了，雷欧奥特曼要是失败，日本将会被毁灭！果然，雷欧胸前的计时器开始闪烁了，他站起身来，冲上前去，继续与孪生怪兽搏斗，但是没几回合，又败下阵来。
洪水继续汹涌，怪兽继续咆哮。
雷欧奥特曼，在地球上的生命，只有2分40秒，彩色指示灯开始闪烁了。雷欧奥特曼以及地球人类的命运，将会怎样呢？
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