为了适应高等教育改革，确保高等教育的健康发展和质量，以及维护国家学历制度的严肃性，保护高等学校毕业生的权益，教育部于2001年2月5日发布了高等教育学历证书电子注册管理暂行规定。
高等教育机构，如普通高校和承担研究生培养的科研机构，根据国家招生规定录取的学生，以及参加高等教育自学考试和学历文凭考试的学生，他们的学历证书会被进行电子注册。这个过程利用现代信息技术，通过计算机网络进行管理。
教育部授权各省级教育行政部门负责学历证书的注册工作，教育部会对已注册的证书进行审核和备案，只有经过审核备案的证书才会被国家承认并受到保护。学历证书分为毕业证书和结业证书两种类型。
普通高等教育和成人高等教育的毕业证书包含学生姓名、性别、出生日期、专业、层次、学习形式、学校印章和校长签名等信息。高等教育自学考试和学历文凭考试的毕业证书则包含姓名、性别、身份证号、专业层次、学校印章等。
证书注册的编排规则对于不同类型的高等教育机构略有不同，如普通和成人高等教育的注册号由学校代码、办学类型代码、年份和顺序号组成，而自学考试的注册号则包含办学类型、层次代码和考试考次等详细信息。
学历证书电子注册制度自2001年起实施，未经注册的证书将不被国家承认。漏报或错报的证书需经相关机构修正后重新注册。各教育机构需严格管理学历证书，确保公正和真实。
对于民办院校的毕业生，虽然其学历证书与全日制高校的有所区别，但根据《民办教育促进法》规定，他们在升学、就业等方面享有与公办学校毕业生同等权利。证书在求职、内部评估等方面具有广泛认可度，且在民办院校网站上可进行电子注册，以验证证书真伪。
毕业证书是做为学生毕业的凭证。学满学制规定的年限，完成教学计划规定的全部课程，各科成绩合格者可以毕全国统一的高等教育毕业证封皮业，获得毕业证书。毕业证书基本内容为姓名，性别，出生日期，毕业时间，学制，毕业专业，发证时间，电子注册号，学校校章，学校钢印，校长印等。