石室清珙禅师的作品丰富多样，他的诗歌创作尤其引人注目。以下是他的部分代表作:
《石屋清珙禅师山居诗》描绘了他在霅溪西的山居生活，如“吾家霅溪西，水满天湖月满溪。未到尽惊山险峻，曾来方识路高低。”
《石屋清洪禅师语录》记录了他的禅宗思想和生活智慧，如“柴门虽设未尝关，闲看幽禽自往还。”
《石屋珙禅师诗集》收录了更多的禅意诗篇，如“禅余高诵寒山偈，饭后浓煎谷雨茶。”
《古今禅藻集》中收录了他二十五首诗作，展示了他对禅宗的深刻理解和感悟。
《元诗选》和《宋元诗会》则分别收录了他的三十三首和十二首诗，展现出禅师的文学才华。
他的作品不仅诗艺精湛，还富含禅意哲思，如“口体无厌宜节俭，光阴有限莫贪求。”以及“百年日月闲中度，八万尘劳静处消。”