中医治疗
腘窝囊肿患者很多合并有膝关节的骨性关节炎、软骨损伤、游离体等。病变导致了腓肠肌内侧头滑膜囊的开口成为单向活瓣，关节液只能向滑膜囊单向流动，难以逆流，从而使滑膜囊积液增多，体积增大形成囊肿。
腘窝囊肿的穿刺抽吸和开放手术的复发率都很高。穿刺抽吸不能解除腘窝囊肿产生的病因，复发不难理解。开放手术失败的原因可能是由于术中解剖变异、手术技巧等原因常常难以正确判断囊肿的开口；有时甚至不能完整切除囊壁。
腘窝囊肿用中医传统膏药外治，你可以对症使用，比方说如果是骨性关节炎引起的可以同时贴敷腘窝囊肿和膝关节疼痛处，对症的话2－3天就会有明显好转。
5西医治疗
儿童与成人的腘窝囊肿有一定差别，儿童常不与关节相通，极少合并关节内病变，一般可自愈。但成人常伴有关节内病变，手术切除囊肿的同时要治疗关节内病变，否则易复发。原则上腘窝囊肿均应切除，术前行关节镜检查，大部分可用后内侧切口或后侧切口。术后行直腿抬高及股四头肌练习。
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