地理隔离就是指一个物种的两个族群受到地形的阻碍，不能彼此交流，导致进化方向的不同，以至于产生差异（产生亚种，虽然有差异，但是交配的后代能生育后代）。这个时候，如果地理上的障碍消失之后，那么物种的进化方向一致，就会逐渐消除这种变化。 但是，这个障碍一直没有消失，就达到下个阶段——生殖隔离了。生殖隔离就会产生新的物种（其后代不能生育后代，如马和驴的后代骡不能生育）。 可见，不管是地理隔离还是生殖隔离都不会阻碍基因的交流。但是有时候不同种群间的个体，在自然条件下基因不能自由交流，这就是基因隔离，属于偶然现象。具体请搜索遗传学。
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