白板笔和马克笔的区别是：白板笔是一种在白板上进行书写的工具，类似于黑板的粉笔。这种笔是用油墨作为墨水，可写在光滑的白板上，并可用白板擦擦掉。马克笔，又名记号笔。是一种书写或绘画专用的绘图彩色笔，本身含有墨水，且通常附有笔盖，一般拥有坚软笔头。马克笔的颜料具有易挥发性，用于一次性地快速绘图。
白板笔含化学原料，会有化学原料的味道。墨水凝固后表面形成一层黏膜，擦拭后成为条状或块状颗粒，无任何污渍存留于板上或板擦上，实地测试时可用手指代替板擦擦拭测试其效果。在同行业中处于领先水平笔头蘸水后依然可以书写流畅不套笔套让笔头完全暴露在空气中，不管多久都可以再次书写流畅。
马克笔常使用于设计物品、广告标语、海报绘制或其他美术创作等场合。可画出变化不大的、较粗的线条。箱头笔为马克笔的一种。马克笔还有分为水性和油性的墨水，水性的墨水就类似彩色笔，是不含油精成分的内容物，油性的墨水因为含有油精成分，故味道比较刺激，而且较容易挥发。如果玩具掉漆可以用马克笔补色。